RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482549.5

PRKRIP1-207, Transcript of PRKR interacting protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKRIP1, Length 1,625 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1-207ENST00000482549 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PRKRIP1-207ENST00000482549 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PRKRIP1-207ENST00000482549 SERPINA9Q86WD7 417 aa25.15■■□□□ 1.62
PRKRIP1-207ENST00000482549 SMRP1Q8NCR6 262 aa25.15■■□□□ 1.62
PRKRIP1-207ENST00000482549 SGF29Q96ES7 293 aa25.15■■□□□ 1.62
PRKRIP1-207ENST00000482549 ZFYVE19Q96K21 471 aa25.15■■□□□ 1.62
PRKRIP1-207ENST00000482549 CNDP1Q96KN2 507 aa25.15■■□□□ 1.62
PRKRIP1-207ENST00000482549 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa25.15■■□□□ 1.62
PRKRIP1-207ENST00000482549 A8MT66 165 aa25.14■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 ZBTB14O43829 449 aa25.14■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 NCALDP61601 193 aa25.14■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 FCHO2Q0JRZ9 810 aa25.14■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 PAQR3Q6TCH7 311 aa25.14■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 TRIM67Q6ZTA4 783 aa25.14■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 CPA6Q8N4T0 437 aa25.14■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 ZNF781Q8N8C0 355 aa25.14■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 PBXIP1Q96AQ6 731 aa25.14■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 PTERQ96BW5 349 aa25.14■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 TUBB6Q9BUF5 446 aa25.14■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 CLPBQ9H078 707 aa25.14■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 B4GALT6Q9UBX8 382 aa25.14■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 PLA2G4CQ9UP65 541 aa25.14■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 AGAP14A8MT82 685 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 SLCO1B7G3V0H7 640 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 H3BMM5 538 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 CCDC22O60826 627 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 SMIM24O75264 130 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 LEFTY1O75610 366 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 LHCGRP22888 699 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 ACRV1P26436 265 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 MAGEA9P43362 315 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 CHRNA6Q15825 494 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 CFAP157Q5JU67 520 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 TANGO2Q6ICL3 276 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 VITQ6UXI7 678 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 STON2Q8WXE9 905 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 KIAA1191Q96A73 305 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 HPS4Q9NQG7 708 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 CRLS1Q9UJA2 301 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 GNPTGQ9UJJ9 305 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 UPK3BL1B0FP48 263 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 E5RI56 91 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 UPK3BL2E5RIL1 263 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 NIPSNAP2O75323 286 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 TPBGLP0DKB5 382 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 VIPR1P32241 457 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 PTSQ03393 145 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 ZNF805Q5CZA5 627 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 ARSIQ5FYB1 569 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 ATAT1Q5SQI0 421 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 CAPN7Q9Y6W3 813 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 CFAP73A6NFT4 308 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 FCHO1O14526 889 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 ZNF195O14628 629 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 KERAO60938 352 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 SP100P23497 879 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 RPL14P50914 215 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 ARHGEF7Q14155 803 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 CES5AQ6NT32 575 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 KIRREL3Q8IZU9 778 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 CCNYL1Q8N7R7 359 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 GPR26Q8NDV2 337 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 STAG3L4Q8TBR4 150 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 CD200R1Q8TD46 325 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 ULK4Q96C45 1275 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 L3HYPDHQ96EM0 354 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 PKD2L2Q9NZM6 624 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 CDH22Q9UJ99 828 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 SORCS3Q9UPU3 1222 aa25.12■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 COL4A3Q01955 1670 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 DOCK8Q8NF50 2099 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 GRXCR2A6NFK2 248 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 NEMP2A6NFY4 417 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 A8MX80 341 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 GPR39O43194 453 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 MBTPS2O43462 519 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 CHRNGP07510 517 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 C1SP09871 688 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 CHRM3P20309 590 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 SLC6A11P48066 632 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 SPINT3P49223 89 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 KRT72Q14CN4 511 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 NXPE1Q8N323 547 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 NXPE3Q969Y0 559 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 RILPQ96NA2 401 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 TMEM237Q96Q45 408 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 ATOH8Q96SQ7 321 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 TRMOQ9BU70 441 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 RAD18Q9NS91 495 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKRIP1-207ENST00000482549 VTI1BQ9UEU0 232 aa25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms