RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469728.5

RTEL1-208, Transcript of regulator of telomere elongation helicase 1, human

TSL 3

Gene RTEL1, Length 601 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RTEL1-208	ENST00000469728	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	LILRA5	A6NI73	299 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	ZNF487	B1APH4	448 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	ARHGAP6	O43182	974 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	GRID2	O43424	1007 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	NUAK1	O60285	661 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	EML2	O95834	649 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	MPST	P25325	297 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	CCR10	P46092	362 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	UBASH3A	P57075	661 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	FANCC	Q00597	558 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	MC1R	Q01726	317 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	KCNAB2	Q13303	367 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	MAP7	Q14244	749 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	QPCT	Q16769	361 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	H2AFV	Q71UI9	128 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	VSIG1	Q86XK7	387 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	CCNY	Q8ND76	341 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	NCSTN	Q92542	709 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	DTL	Q9NZJ0	730 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	MMP2	P08253	660 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	ACP5	P13686	325 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	CD86	P42081	329 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	POLE2	P56282	527 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	DCDC1	P59894	354 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	GBE1	Q04446	702 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	NFATC2	Q13469	925 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	SLC14A2	Q15849	920 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	PQLC3	Q8N755	202 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	RNF157	Q96PX1	679 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	TRIM4	Q9C037	500 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	NENF	Q9UMX5	172 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	KCNK6	Q9Y257	313 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	MAST4	O15021	2626 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728		A8MU76	341 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	CHUK	O15111	745 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	KMO	O15229	486 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	SNX2	O60749	519 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	STK17B	O94768	372 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	JCHAIN	P01591	159 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	C9	P02748	559 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	KDELR1	P24390	212 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	GJC1	P36383	396 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	TAS2R40	P59535	323 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	NFKB2	Q00653	900 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	SLC18A3	Q16572	532 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	ESX1	Q8N693	406 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	CNTD1	Q8N815	330 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RTEL1-208	ENST00000469728	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		10.8	□□□□□ -0.68

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