RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 PNLIPP16233 465 aa23.73■■□□□ 1.39
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SMKR1-201ENST00000462322 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
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SMKR1-201ENST00000462322 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa23.73■■□□□ 1.39
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SMKR1-201ENST00000462322 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa23.73■■□□□ 1.39
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SMKR1-201ENST00000462322 MEI1Q5TIA1 1274 aa23.72■■□□□ 1.39
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SMKR1-201ENST00000462322 GABREP78334 506 aa23.71■■□□□ 1.39
SMKR1-201ENST00000462322 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa23.71■■□□□ 1.39
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SMKR1-201ENST00000462322 TBL1YQ9BQ87 522 aa23.71■■□□□ 1.39
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM121Q9BTD3 319 aa23.71■■□□□ 1.39
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SMKR1-201ENST00000462322 EPB41L5Q9HCM4 733 aa23.68■■□□□ 1.38
SMKR1-201ENST00000462322 TBC1D29Q9UFV1 150 aa23.68■■□□□ 1.38
SMKR1-201ENST00000462322 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa23.68■■□□□ 1.38
SMKR1-201ENST00000462322 CHUKO15111 745 aa23.67■■□□□ 1.38
SMKR1-201ENST00000462322 KMOO15229 486 aa23.67■■□□□ 1.38
SMKR1-201ENST00000462322 B4GAT1O43505 415 aa23.67■■□□□ 1.38
SMKR1-201ENST00000462322 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
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