RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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SCAF8-204ENST00000461219 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SCAF8-204ENST00000461219 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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SCAF8-204ENST00000461219 GPR89BP0CG08 455 aa20.29■□□□□ 0.84
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SCAF8-204ENST00000461219 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa20.28■□□□□ 0.84
SCAF8-204ENST00000461219 CERCAMQ5T4B2 595 aa20.28■□□□□ 0.84
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SCAF8-204ENST00000461219 NRROSQ86YC3 692 aa20.28■□□□□ 0.84
SCAF8-204ENST00000461219 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa20.28■□□□□ 0.84
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SCAF8-204ENST00000461219 BRSK1Q8TDC3 778 aa20.28■□□□□ 0.84
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SCAF8-204ENST00000461219 CCNJLQ8IV13 435 aa20.27■□□□□ 0.84
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SCAF8-204ENST00000461219 OR4K2Q8NGD2 314 aa20.27■□□□□ 0.84
SCAF8-204ENST00000461219 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
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SCAF8-204ENST00000461219 HOMER3Q9NSC5 361 aa20.27■□□□□ 0.84
SCAF8-204ENST00000461219 APPL1Q9UKG1 709 aa20.27■□□□□ 0.84
SCAF8-204ENST00000461219 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa20.27■□□□□ 0.84
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SCAF8-204ENST00000461219 JRKLQ9Y4A0 524 aa20.27■□□□□ 0.84
SCAF8-204ENST00000461219 RNF215Q9Y6U7 377 aa20.27■□□□□ 0.84
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SCAF8-204ENST00000461219 AP2A1O95782 977 aa20.26■□□□□ 0.83
SCAF8-204ENST00000461219 VCLP18206 1134 aa20.26■□□□□ 0.83
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SCAF8-204ENST00000461219 CDCP2Q5VXM1 449 aa20.26■□□□□ 0.83
SCAF8-204ENST00000461219 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa20.26■□□□□ 0.83
SCAF8-204ENST00000461219 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SCAF8-204ENST00000461219 NRSN2Q9GZP1 204 aa20.26■□□□□ 0.83
SCAF8-204ENST00000461219 LRRN3Q9H3W5 708 aa20.26■□□□□ 0.83
SCAF8-204ENST00000461219 KLC4Q9NSK0 619 aa20.26■□□□□ 0.83
SCAF8-204ENST00000461219 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SCAF8-204ENST00000461219 PAK5Q9P286 719 aa20.26■□□□□ 0.83
SCAF8-204ENST00000461219 KIF26BQ2KJY2 2108 aa20.26■□□□□ 0.83
SCAF8-204ENST00000461219 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa20.25■□□□□ 0.83
SCAF8-204ENST00000461219 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SCAF8-204ENST00000461219 PNLIPP16233 465 aa20.25■□□□□ 0.83
SCAF8-204ENST00000461219 TPH1P17752 444 aa20.25■□□□□ 0.83
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