RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
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PTPRJ-201ENST00000418331 AGAP2Q99490 1192 aa21.29■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 RNF39Q9H2S5 420 aa21.29■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC28A3Q9HAS3 691 aa21.29■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 TXNRD2Q9NNW7 524 aa21.29■■□□□ 1
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PTPRJ-201ENST00000418331 SLC39A4Q6P5W5 647 aa21.29■■□□□ 1
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PTPRJ-201ENST00000418331 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
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PTPRJ-201ENST00000418331 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa21.27■■□□□ 1
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