RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 POU6F1Q14863 301 aa20.63■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 PROX2Q3B8N5 592 aa20.63■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 TEX35Q5T0J7 233 aa20.63■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 HIC2Q96JB3 615 aa20.63■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa20.63■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 IL22Q9GZX6 179 aa20.63■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 MOSPD1Q9UJG1 213 aa20.63■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa20.63■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 NCOR2Q9Y618 2525 aa20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 GIMD1P0DJR0 217 aa20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 CDK4P11802 303 aa20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 HMGCLP35914 325 aa20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 TUBB4BP68371 445 aa20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 CAV1Q03135 178 aa20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 DEFB133Q30KQ1 61 aa20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 CERCAMQ5T4B2 595 aa20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 ALS2CLQ60I27 953 aa20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 PDPK2PQ6A1A2 396 aa20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 GKN2Q86XP6 184 aa20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 TTC30BQ8N4P2 665 aa20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 FAM181AQ8N9Y4 354 aa20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 SEC14L1Q92503 715 aa20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 GLMNQ92990 594 aa20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 EID2BQ96D98 161 aa20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 SPATA16Q9BXB7 569 aa20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 CAAP1Q9H8G2 361 aa20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 EPB41L5Q9HCM4 733 aa20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 CYP4F12Q9HCS2 524 aa20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 FAM114A2Q9NRY5 505 aa20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 TOR4AQ9NXH8 423 aa20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 GRHL1Q9NZI5 618 aa20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 PKP3Q9Y446 797 aa20.62■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 ESYT3A0FGR9 886 aa20.61■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 HEATR9A2RTY3 570 aa20.61■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 AURKAO14965 403 aa20.61■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 RFPL3O75679 317 aa20.61■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 IVLP07476 585 aa20.61■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 RHOXF2BP0C7M4 288 aa20.61■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 LPOP22079 712 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 MGAT1P26572 445 aa20.61■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 ACADVLP49748 655 aa20.61■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 ILKQ13418 452 aa20.61■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 C1orf61Q13536 156 aa20.61■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 DOK6Q6PKX4 331 aa20.61■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 LVRNQ6Q4G3 990 aa20.61■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 PDIK1LQ8N165 341 aa20.61■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 TRAM1L1Q8N609 369 aa20.61■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 APOLD1Q96LR9 279 aa20.61■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 RANBP9Q96S59 729 aa20.61■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 AGAP2Q99490 1192 aa20.61■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 RHOXF2Q9BQY4 288 aa20.61■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa20.61■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 ARL5AQ9Y689 179 aa20.61■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 INPP4BO15327 924 aa20.6■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 STX7O15400 261 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 PPFIA2O75334 1257 aa20.6■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 AVILO75366 819 aa20.6■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 DKK1O94907 266 aa20.6■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 CEACAM5P06731 702 aa20.6■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 ACP1P24666 158 aa20.6■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 ADRA1DP25100 572 aa20.6■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 ARL4CP56559 192 aa20.6■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 SHC2P98077 582 aa20.6■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 DNAJC3Q13217 504 aa20.6■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 CCDC157Q569K6 752 aa20.6■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 PCID2Q5JVF3 399 aa20.6■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa20.6■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 ARMC3Q5W041 872 aa20.6■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 NLRP9Q7RTR0 991 aa20.6■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 SLCO6A1Q86UG4 719 aa20.6■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 GPR26Q8NDV2 337 aa20.6■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 ART4Q93070 314 aa20.6■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 COX14Q96I36 57 aa20.6■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 FAM129AQ9BZQ8 928 aa20.6■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 CLPBQ9H078 707 aa20.6■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 VPS18Q9P253 973 aa20.6■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 TCAF1Q9Y4C2 921 aa20.6■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 SDR42E2A6NKP2 422 aa20.59■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 FADS2P1A8MWK0 482 aa20.59■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 LDB2O43679 373 aa20.59■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 CKMT1AP12532 417 aa20.59■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 BPIP17213 487 aa20.59■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 MAGEA3P43357 314 aa20.59■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 RPIAP49247 311 aa20.59■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 PLTPP55058 493 aa20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.6 ms