RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 RNF139Q8WU17 664 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 GAB3Q8WWW8 586 aa6.65□□□□□ -1.34
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CCL20-202ENST00000409189 FAM3CQ92520 227 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 EXOC4Q96A65 974 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SCYL1Q96KG9 808 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 B3GALT6Q96L58 329 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SERPINB11Q96P15 392 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CDC6Q99741 560 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TMEM121Q9BTD3 319 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TMEM109Q9BVC6 243 aa6.65□□□□□ -1.34
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CCL20-202ENST00000409189 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ABCC13Q9NSE7 274 aa6.65□□□□□ -1.34
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CCL20-202ENST00000409189 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 DDIT4Q9NX09 232 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PSD3Q9NYI0 1048 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 VPS18Q9P253 973 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 STK39Q9UEW8 545 aa6.65□□□□□ -1.34
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CCL20-202ENST00000409189 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
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CCL20-202ENST00000409189 RELNP78509 3460 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 MTMR11A4FU01 709 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 A6NNZ2 444 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 MFSD11O43934 449 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 RPP40O75818 363 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 KRT38O76015 456 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 IFNB1P01574 187 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 URODP06132 367 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 FYNP06241 537 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 RPL17P18621 184 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CR2P20023 1033 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 FCARP24071 287 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 IL4RP24394 825 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ATP5DP30049 168 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 MAGEA6P43360 314 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CXCR3P49682 368 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 VPS41P49754 854 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TPI1P60174 286 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 IL13RA1P78552 427 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 GPS1Q13098 491 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 GPR17Q13304 367 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 PDK1Q15118 436 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 UAP1L1Q3KQV9 507 aa6.64□□□□□ -1.35
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CCL20-202ENST00000409189 TTMPQ5BVD1 217 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 FAM171A1Q5VUB5 890 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 RFX8Q6ZV50 586 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CENPUQ71F23 418 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 GPR65Q8IYL9 337 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CNPY4Q8N129 248 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 NUP93Q8N1F7 819 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 PTPRN2Q92932 1015 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 PGM2Q96G03 612 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SPATA17Q96L03 361 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 KCNK16Q96T55 309 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 FAM118BQ9BPY3 351 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TTPALQ9BTX7 342 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 BRD8Q9H0E9 1235 aa6.64□□□□□ -1.35
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CCL20-202ENST00000409189 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 PIGVQ9NUD9 493 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CLIC5Q9NZA1 410 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 FNIP2Q9P278 1114 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 HSFX1Q9UBD0 423 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 MTRRQ9UBK8 725 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 FETUBQ9UGM5 382 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SCML2Q9UQR0 700 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 NFS1Q9Y697 457 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 VWA8A3KMH1 1905 aa6.64□□□□□ -1.35
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