RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409178.5

C10orf55-201, Transcript of chromosome 10 open reading frame 55, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C10orf55, Length 2,513 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55-201ENST00000409178 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 TRIM8Q9BZR9 551 aa21.45■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 VPS26AO75436 327 aa21.45■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 LBPP18428 481 aa21.45■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 PSMA3P25788 255 aa21.45■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 LIN52Q52LA3 116 aa21.45■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 DEFB128Q7Z7B8 93 aa21.45■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 CPNE9Q8IYJ1 553 aa21.45■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 TTC30BQ8N4P2 665 aa21.45■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 CATSPER1Q8NEC5 780 aa21.45■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 ADGRE3Q9BY15 652 aa21.45■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 SCN5AQ14524 2016 aa21.44■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 EFEMP2O95967 443 aa21.44■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 CAPNS1P04632 268 aa21.44■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 PYGLP06737 847 aa21.44■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 NRF1Q16656 503 aa21.44■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 TAS2R42Q7RTR8 314 aa21.44■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 TOP1MTQ969P6 601 aa21.44■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 RETREG1Q9H6L5 497 aa21.44■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 CREBZFQ9NS37 354 aa21.44■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 LHX3Q9UBR4 397 aa21.44■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 PCTPQ9UKL6 214 aa21.44■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 RAB26Q9ULW5 256 aa21.44■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 ZNF839A8K0R7 811 aa21.44■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 NME4O00746 187 aa21.44■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 TBL1XO60907 577 aa21.44■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 TAF12Q16514 161 aa21.44■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 NCEH1Q6PIU2 408 aa21.44■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 HERC6Q8IVU3 1022 aa21.44■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa21.44■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 SLC22A12Q96S37 553 aa21.44■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 ACOX2Q99424 681 aa21.44■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 YIPF1Q9Y548 306 aa21.44■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 SYCE1LA8MT33 242 aa21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 FESP07332 822 aa21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 SMIM18P0DKX4 95 aa21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 CTPS1P17812 591 aa21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 ATP6V1B2P21281 511 aa21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 TTPAP49638 278 aa21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 POLE2P56282 527 aa21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 RBBP7Q16576 425 aa21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 EME1Q96AY2 570 aa21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 ROPN1LQ96C74 230 aa21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 EID2BQ96D98 161 aa21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 TEX37Q96LM6 180 aa21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 SNX13Q9Y5W8 968 aa21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 BACE2Q9Y5Z0 518 aa21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 H0Y626 953 aa21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 PGM3O95394 542 aa21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 APLP1P51693 650 aa21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 MTX3Q5HYI7 312 aa21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 AMIGO2Q86SJ2 522 aa21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 OR6K2Q8NGY2 324 aa21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 WFDC5Q8TCV5 224 aa21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 IGSF21Q96ID5 467 aa21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 Q9H521 79 aa21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 APPL1Q9UKG1 709 aa21.43■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 BBIP1A8MTZ0 92 aa21.42■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 K7ERQ8 282 aa21.42■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 FXYD1O00168 92 aa21.42■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 ANGPT2O15123 496 aa21.42■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 ALPIP09923 528 aa21.42■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 RPS6KA2Q15349 733 aa21.42■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 DHFR2Q86XF0 187 aa21.42■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 CAPNS2Q96L46 248 aa21.42■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa21.42■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 CENPKQ9BS16 269 aa21.42■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 HGH1Q9BTY7 390 aa21.42■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 COQ10BQ9H8M1 238 aa21.42■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 PITPNM1O00562 1244 aa21.42■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 GRIA3P42263 894 aa21.42■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 IL2P60568 153 aa21.42■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 MAP7D1Q3KQU3 841 aa21.42■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 HMBOX1Q6NT76 420 aa21.42■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 SATL1Q86VE3 508 aa21.42■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 ZNF461Q8TAF7 563 aa21.42■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 CDK15Q96Q40 435 aa21.42■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 CD274Q9NZQ7 290 aa21.42■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 E5RI56 91 aa21.41■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 AHCYL1O43865 530 aa21.41■■□□□ 1.02
C10orf55-201ENST00000409178 KLK8O60259 260 aa21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms