RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa9.95□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 MAVSQ7Z434 540 aa9.95□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 CCNYL1Q8N7R7 359 aa9.95□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 OR2AP1Q8NGE2 309 aa9.95□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 SUN5Q8TC36 379 aa9.95□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 PIH1D2Q8WWB5 315 aa9.95□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 LPGAT1Q92604 370 aa9.95□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 IRF7Q92985 503 aa9.95□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM136AQ96C01 138 aa9.95□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 TCF12Q99081 682 aa9.95□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 CGREF1Q99674 301 aa9.95□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 CDH19Q9H159 772 aa9.95□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 POMKQ9H5K3 350 aa9.95□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 MAGEE1Q9HCI5 957 aa9.95□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 ARHGEF3Q9NR81 526 aa9.95□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 DNAJC28Q9NX36 388 aa9.95□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC25A13Q9UJS0 675 aa9.95□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa9.95□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa9.95□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 SCN8AQ9UQD0 1980 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 CDH23Q9H251 3354 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 NEMP2A6NFY4 417 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 SOBPA7XYQ1 873 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 BNIP3LO60238 219 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 SRP72O76094 671 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 CEBPBP17676 345 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 TFEBP19484 476 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 CCND1P24385 295 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 MPSTP25325 297 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 SERPINA4P29622 427 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 FMO4P31512 558 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 TTPAP49638 278 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 RPL26P61254 145 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF77Q15935 545 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 DGKKQ5KSL6 1271 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 TMEM207Q6UWW9 146 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 LILRB2Q8N423 598 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 INPP5DQ92835 1189 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 LMLNQ96KR4 655 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 ZSWIM3Q96MP5 696 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 TUBB6Q9BUF5 446 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 LINC00597Q9H2U6 94 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 ALG9Q9H6U8 611 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 TLE6Q9H808 572 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 POPDC3Q9HBV1 291 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 SPHK2Q9NRA0 654 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 ARL8BQ9NVJ2 186 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 TBC1D14Q9P2M4 693 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 DPP7Q9UHL4 492 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 HS3ST2Q9Y278 367 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 RAP2CQ9Y3L5 183 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 CEP290O15078 2479 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 A0A0J9YYE9 177 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 H7C0S8 307 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF197O14709 1029 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 RHOBTB1O94844 696 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 TRBC1P01850 177 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 SERPINA6P08185 405 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 KRT16P08779 473 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 TYRP14679 529 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 HMGCLP35914 325 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 CCR10P46092 362 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 IDH3AP50213 366 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 SUOXP51687 545 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 PFKPQ01813 784 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 PRKAA1Q13131 559 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 GPM6BQ13491 265 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 PEX6Q13608 980 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 LY6G5CQ5SRR4 150 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM91A1Q658Y4 838 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 C22orf39Q6P5X5 142 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM20CQ8IXL6 584 aa9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms