RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

BASIC

Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 SPASTQ9UBP0 616 aa3.44□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 GULP1Q9UBP9 304 aa3.44□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 FTSJ1Q9UET6 329 aa3.44□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa3.44□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 FKBPLQ9UIM3 349 aa3.44□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 KLK13Q9UKR3 277 aa3.44□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa3.44□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa3.44□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa3.44□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 LOC400499M0QZD8 3231 aa3.44□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CHD8Q9HCK8 2581 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 A0A1W2PQM1 296 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 A6NCN8 305 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 MROH6A6NGR9 719 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 OR51F1A6NGY5 319 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 H3BM21 787 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 TAF4O00268 1085 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CES2O00748 559 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CHUKO15111 745 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 TP73O15350 636 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 STX7O15400 261 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 GRID2O43424 1007 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 B4GAT1O43505 415 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 NRDCO43847 1150 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 KIF5CO60282 957 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 OPA1O60313 960 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 PHF2O75151 1096 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 RFPL3O75679 317 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 SRP72O76094 671 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 STK10O94804 968 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM63AO94886 807 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ASMTLO95671 621 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ECEL1O95672 775 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ANXA6P08133 673 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 C1QTNF9P0C862 333 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ACP5P13686 325 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CTSEP14091 401 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 BRAFP15056 766 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 LPOP22079 712 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 NFKBIAP25963 317 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 IVDP26440 423 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ARNTP27540 789 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 HTR1BP28222 390 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 FOXN2P32314 431 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 FDFT1P37268 417 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 SPAM1P38567 509 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 MAGEA6P43360 314 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 VPS41P49754 854 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 PDX1P52945 283 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 TERF1P54274 439 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 MAZP56270 477 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 GNG11P61952 73 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CRADDP78560 199 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CCL7P80098 99 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CFHR1Q03591 330 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 PRPSAP1Q14558 356 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 SEMA3AQ14563 771 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 KCNJ11Q14654 390 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 POU6F1Q14863 301 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ELOCQ15369 112 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CCDC157Q569K6 752 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 GPRC6AQ5T6X5 926 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CCDC70Q6NSX1 233 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 SLC30A9Q6PML9 568 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 LVRNQ6Q4G3 990 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 TAF8Q7Z7C8 310 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 GKN2Q86XP6 184 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 PIANPQ8IYJ0 282 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 MPP5Q8N3R9 675 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ARL14Q8N4G2 192 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ARL10Q8N8L6 244 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 FAM46DQ8NEK8 389 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 DDHD1Q8NEL9 900 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 OR13J1Q8NGT2 312 aa3.43□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ATL2Q8NHH9 583 aa3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms