RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368530.6

TPM3-210, Transcript of tropomyosin 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPM3, Length 1,523 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3-210ENST00000368530 CTSLP07711 333 aa9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 RHOCP08134 193 aa9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 GSTA2P09210 222 aa9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 GLDCP23378 1020 aa9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 NUDT1P36639 197 aa9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 NNMTP40261 264 aa9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 RENBPP51606 427 aa9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 CDH4P55283 916 aa9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 DSC2Q02487 901 aa9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 GNA12Q03113 381 aa9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 TLE3Q04726 772 aa9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 IL10RBQ08334 325 aa9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 NIPAL4Q0D2K0 466 aa9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 C19orf57Q0VDD7 668 aa9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 CRYMQ14894 314 aa9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 DLG2Q15700 870 aa9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 C5orf22Q49AR2 442 aa9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 CDCP2Q5VXM1 449 aa9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 STEAP4Q687X5 459 aa9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 ADGRD1Q6QNK2 874 aa9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 TAX1BP1Q86VP1 789 aa9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 SLC44A1Q8WWI5 657 aa9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 OR8D1Q8WZ84 308 aa9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 PPCSQ9HAB8 311 aa9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 UCKL1Q9NWZ5 548 aa9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 FETUBQ9UGM5 382 aa9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 CLCA2Q9UQC9 943 aa9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 ZNF462Q96JM2 2506 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 ANKRD36A6QL64 1941 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 GOLGA8RI6L899 631 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 RRP8O43159 456 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 PRAMEF11O60813 436 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 CLDN11O75508 207 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 MT-CO1P00395 513 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 DGKAP23743 735 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 CD86P42081 329 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 NPY2RP49146 381 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 SEC24CP53992 1094 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 OXCT1P55809 520 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 ATMQ13315 3056 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 BMPR2Q13873 1038 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 MPP2Q14168 576 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 ZNF235Q14590 738 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 LBRQ14739 615 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 TBC1D25Q3MII6 688 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 POM121L1PQ3SYA9 428 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 TMCO4Q5TGY1 634 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 FAM46CQ5VWP2 391 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 TENM4Q6N022 2769 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 Q6ZVU0 165 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 LINC00523Q86TU6 105 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 SLC26A11Q86WA9 606 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 SPACA3Q8IXA5 215 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 PGBD5Q8N414 524 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 ZNF843Q8N446 348 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 SLC25A41Q8N5S1 370 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 OR4C6Q8NH72 309 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 GDAP1Q8TB36 358 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 HIC2Q96JB3 615 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 SMC6Q96SB8 1091 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 FSD1LQ9BXM9 530 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 FAM107BQ9H098 131 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 MUC3BQ9H195 1237 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 MAGEH1Q9H213 219 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 U3KQA8 63 aa9.95□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa9.94□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 FAM159BA6NKW6 160 aa9.94□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 MAGEC1O60732 1142 aa9.94□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 MT-CO3P00414 261 aa9.94□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 MT-ND3P03897 115 aa9.94□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 POLBP06746 335 aa9.94□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 F7P08709 466 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 ERVK-10P10266 1014 aa9.94□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 SRCP12931 536 aa9.94□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 CHRNA4P43681 627 aa9.94□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 WNT3AP56704 352 aa9.94□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 E2F1Q01094 437 aa9.94□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 CDH17Q12864 832 aa9.94□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 SEPT6Q14141 434 aa9.94□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 RASA2Q15283 850 aa9.94□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 ZNF284Q2VY69 593 aa9.94□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 SPANXN3Q5MJ09 141 aa9.94□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
TPM3-210ENST00000368530 KDELC1Q6UW63 502 aa9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms