RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362913.1

SNORD56.1-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 68 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56.1-201ENST00000362913 AKR1B1P15121 316 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 LMO1P25800 156 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 TAS2R38P59533 333 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 TUBA1BP68363 451 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 CXCL9Q07325 125 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 GAGE2BQ13066 116 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 TNFAIP1Q13829 316 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 BECN1Q14457 450 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 MVPQ14764 893 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 SYT16Q17RD7 645 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 GAGE2EQ4V326 116 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 XKR9Q5GH70 373 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 GARNL3Q5VVW2 1013 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 GAGE2AQ6NT46 116 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 NRROSQ86YC3 692 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 SCYL3Q8IZE3 742 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 MINDY1Q8N5J2 469 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 GCSAMQ8N6F7 178 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 IL17RCQ8NAC3 791 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 POMGNT2Q8NAT1 580 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 HM13Q8TCT9 377 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 ASB5Q8WWX0 329 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 MIB2Q96AX9 1013 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 SLC22A18Q96BI1 424 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 GRAMD2BQ96HH9 432 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 LYZL4Q96KX0 146 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 CEP295NLQ96MC4 621 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 SLF1Q9BQI6 1058 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 SPRY4Q9C004 299 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 MMP27Q9H306 513 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 PIGMQ9H3S5 423 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 PDE7BQ9NP56 450 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 ZNF224Q9NZL3 707 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 GAGE2DQ9UEU5 116 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 AMACRQ9UHK6 382 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 NRBP1Q9UHY1 535 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 AMDHD2Q9Y303 409 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 SNX9Q9Y5X1 595 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 ZNF541Q9H0D2 1346 aa2.6□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 TTC3P53804 2025 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 LNP1A1A4G5 178 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 LINC01553A4QN01 128 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 LILRA5A6NI73 299 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 GJB3O75712 270 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 ADRB2P07550 413 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 MMP9P14780 707 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 PRLRP16471 622 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 NR2F2P24468 414 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 SSTR2P30874 369 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 CCKBRP32239 447 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 USP8P40818 1118 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 CTSCP53634 463 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 SIRPAP78324 504 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 PDE1BQ01064 536 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 BNC1Q01954 994 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 LTBQ06643 244 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 TRAF3Q13114 568 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 NFATC4Q14934 902 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 KCNT1Q5JUK3 1230 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 C18orf63Q68DL7 685 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 RGMBQ6NW40 437 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 SLC30A6Q6NXT4 461 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 WDR73Q6P4I2 378 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 TMCO3Q6UWJ1 677 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 CCDC190Q86UF4 302 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 GPR180Q86V85 440 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 KBTBD6Q86V97 674 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 SCML4Q8N228 414 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 EMC1Q8N766 993 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 AVL9Q8NBF6 648 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 ZNF114Q8NC26 417 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 KCNH5Q8NCM2 988 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 RND1Q92730 232 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 TANKQ92844 425 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 RTP4Q96DX8 246 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 SMC6Q96SB8 1091 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 GAD1Q99259 594 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 MEIS3Q99687 375 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 TXLNGYQ9BZA5 131 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 RTN4RQ9BZR6 473 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 TM6SF1Q9BZW5 370 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 SPATC1LQ9H0A9 340 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 TMEM30AQ9NV96 361 aa2.59□□□□□ -1.99
SNORD56.1-201ENST00000362913 PAG1Q9NWQ8 432 aa2.59□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms