RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 FTH1P19P0C7X4 201 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 PCK1P35558 622 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 HDAC4P56524 1084 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 DR1Q01658 176 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 PLGLB1Q02325 96 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP4.41□□□□□ -1.73e-36■■■■■ 51.8
PTPRC-201ENST00000348564 TUBB2AQ13885 445 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SPDYE7PQ495Y7 208 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 HHATQ5VTY9 493 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 IZUMO3Q5VZ72 239 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF662Q6ZS27 426 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 USP30Q70CQ3 517 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 NLRP9Q7RTR0 991 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 C12orf40Q86WS4 652 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 MMGT1Q8N4V1 131 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 HDAC10Q969S8 669 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 OSBPL9Q96SU4 736 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 NPY6RQ99463 290 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ZSWIM1Q9BR11 485 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TUBB2BQ9BVA1 445 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 PRRG4Q9BZD6 226 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 RABGEF1Q9UJ41 708 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM247A6NEH6 219 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 MKRN2OSH3BPM6 223 aa4.41□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 PSTPIP1O43586 416 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 VPS4BO75351 444 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CYP7B1O75881 506 aa4.41□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 NFATC3Q12968 1075 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 C1orf189Q5VU69 101 aa4.41□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 MON1BQ7L1V2 547 aa4.41□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CCNJLQ8IV13 435 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 IFT20Q8IY31 132 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ZBED8Q8IZ13 594 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TM9SF4Q92544 642 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TSPAN17Q96FV3 270 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 P2RY11Q96G91 374 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SGSM3Q96HU1 749 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CTRCQ99895 268 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SLC29A3Q9BZD2 475 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 MT-ND3P03897 115 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CYP1A2P05177 515 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SLC6A4P31645 630 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 GPC1P35052 558 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CASP2P42575 452 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 GRIA4P48058 902 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 GLRBP48167 497 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ALDH9A1P49189 494 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 PER3P56645 1201 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 GUCY2DQ02846 1103 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TEX44Q53QW1 395 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TMC8Q8IU68 726 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 UBR7Q8N806 425 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 FGF11Q92914 225 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM125Q96AQ2 219 aa4.41□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SYT11Q9BT88 431 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ACTR8Q9H981 624 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 USP29Q9HBJ7 922 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CATSPERZQ9NTU4 200 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF212Q9UDV6 495 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SNX12Q9UMY4 172 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CHMP2BQ9UQN3 213 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 RNF215Q9Y6U7 377 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CDC14CA4D256 554 aa4.4□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM191CA6NGB0 347 aa4.4□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 MATN3O15232 486 aa4.4□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 MFSD11O43934 449 aa4.4□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CMPK1P30085 196 aa4.4□□□□□ -1.7
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