RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 CILP2Q8IUL8 1156 aa27.55■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 MREGQ8N565 214 aa27.55■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 SLC6A18Q96N87 628 aa27.55■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 TCF12Q99081 682 aa27.55■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 APOOQ9BUR5 198 aa27.55■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 OR1A2Q9Y585 309 aa27.55■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 H0Y8X5 98 aa27.54■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 PRSS56P0CW18 603 aa27.54■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 RABIFP47224 123 aa27.54■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 PFN3P60673 137 aa27.54■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 SERPINA9Q86WD7 417 aa27.54■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 DDHD1Q8NEL9 900 aa27.54■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa27.54■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa27.54■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 ITPKAP23677 461 aa27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 DPP6P42658 865 aa27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 TYSND1Q2T9J0 566 aa27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 GPRC6AQ5T6X5 926 aa27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 KIAA0408Q6ZU52 694 aa27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 C1orf216Q8TAB5 229 aa27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 COX14Q96I36 57 aa27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 CYTH2Q99418 400 aa27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 ACSS3Q9H6R3 686 aa27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 TM9SF3Q9HD45 589 aa27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 FAM159BA6NKW6 160 aa27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 CD38P28907 300 aa27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 OVGP1Q12889 678 aa27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 SLC29A2Q14542 456 aa27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 SEMA3AQ14563 771 aa27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 IQCHQ86VS3 1027 aa27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 MFSD2AQ8NA29 543 aa27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 HEXDCQ8WVB3 486 aa27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 COPS8Q99627 209 aa27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 SUSD2Q9UGT4 822 aa27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 RABGEF1Q9UJ41 708 aa27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 R4GN57 208 aa27.53■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 GNSP15586 552 aa27.52■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 HSD17B3P37058 310 aa27.52■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 SLC1A2P43004 574 aa27.52■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 KIAA1024LP59773 190 aa27.52■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 NAB1Q13506 487 aa27.52■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 ITIH4Q14624 930 aa27.52■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 DBN1Q16643 649 aa27.52■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 DENND6AQ8IWF6 608 aa27.52■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 EPB41L4BQ9H329 900 aa27.52■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 FBXO5Q9UKT4 447 aa27.52■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
GIPC1-201ENST00000345425 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa27.51■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 RALBP11234 206 aa27.51■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 HTR1BP28222 390 aa27.51■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 AKT1P31749 480 aa27.51■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 CA5AP35218 305 aa27.51■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 CTBP1Q13363 440 aa27.51■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 KLHL38Q2WGJ6 581 aa27.51■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 KDM7AQ6ZMT4 941 aa27.51■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 Q6ZSR6 202 aa27.51■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 SLC26A11Q86WA9 606 aa27.51■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 CTAGE3PQ8IX95 158 aa27.51■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 PRSS33Q8NF86 280 aa27.51■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 KLHDC7BQ96G42 594 aa27.51■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 RAB23Q9ULC3 237 aa27.51■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa27.51■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 CFAP99D6REC4 459 aa27.5■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 MAGEC1O60732 1142 aa27.5■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 NDUFS3O75489 264 aa27.5■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 C1QAP02745 245 aa27.5■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 KELP23276 732 aa27.5■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 THOP1P52888 689 aa27.5■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 TCF15Q12870 199 aa27.5■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 NFATC4Q14934 902 aa27.5■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 GALNT7Q86SF2 657 aa27.5■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 SKA1Q96BD8 255 aa27.5■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 DCUN1D1Q96GG9 259 aa27.5■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 LGR4Q9BXB1 951 aa27.5■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM39Q9HCM9 518 aa27.5■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 SMYD2Q9NRG4 433 aa27.5■■□□□ 1.99
GIPC1-201ENST00000345425 TXNDC16Q9P2K2 825 aa27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms