RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 CDH19Q9H159 772 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ASB8Q9H765 288 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 POPDC3Q9HBV1 291 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 HPS4Q9NQG7 708 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 EMCNQ9ULC0 261 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 DOCK6Q96HP0 2047 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM265A0A087WTH1 108 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 VPS26AO75436 327 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 RHOBTB1O94844 696 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ESR1P03372 595 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC166P0CW27 439 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 PKMP14618 531 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CD9P21926 228 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 GDI1P31150 447 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 FMO4P31512 558 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 GJA4P35212 333 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 SPAM1P38567 509 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 IRF9Q00978 393 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 BST1Q10588 318 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 IFT88Q13099 833 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 PEX6Q13608 980 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CSHL1Q14406 222 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 GRM2Q14416 872 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CDKN3Q16667 212 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 PARM1Q6UWI2 310 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC121Q6ZUS5 278 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 OTOAQ7RTW8 1153 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 DSG4Q86SJ6 1040 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 C12orf40Q86WS4 652 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 HEXDCQ8WVB3 486 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 KCTD4Q8WVF5 259 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 OR8D1Q8WZ84 308 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 SUSD6Q92537 303 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 LPGAT1Q92604 370 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 NXNL1Q96CM4 212 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC126Q96EE4 140 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 UBXN10Q96LJ8 280 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 MECRQ9BV79 373 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 IL26Q9NPH9 171 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF358Q9NW07 568 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 PKD2L2Q9NZM6 624 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CDH22Q9UJ99 828 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 MYO9BQ13459 2157 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 RGSL1A5PLK6 1076 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 C16orf96A6NNT2 1141 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 A8MX80 341 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 UPK3BL1B0FP48 263 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 PRRT4C9JH25 899 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 UPK3BL2E5RIL1 263 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 H3BMM5 538 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 KAT7O95251 611 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 PRAMEF1O95521 474 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 APODP05090 189 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 BPIP17213 487 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CHRM3P20309 590 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 FDXRP22570 491 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 SUOXP51687 545 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CDKN2DP55273 166 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 NFATC2Q13469 925 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 SEMA3AQ14563 771 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 PTPRRQ15256 657 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 GAB4Q2WGN9 574 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 LRIT3Q3SXY7 679 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC66Q68CR7 880 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ERAP2Q6P179 960 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM151BQ6UXP7 276 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ZYG11AQ6WRX3 759 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 C10orf107Q8IVU9 208 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 PIANPQ8IYJ0 282 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 RBFAQ8N0V3 343 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 TERB1Q8NA31 727 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 MYLIPQ8WY64 445 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 EID2BQ96D98 161 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 OLFM1Q99784 485 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 KXD1Q9BQD3 176 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CLPBQ9H078 707 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM96AQ9H5X1 160 aa10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms