RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 GJA8P48165 433 aa21.36■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 TPGS1Q6ZTW0 290 aa21.36■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 BBS7Q8IWZ6 715 aa21.36■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 CDH22Q9UJ99 828 aa21.36■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 MAFFQ9ULX9 164 aa21.36■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 FAM50BQ9Y247 325 aa21.36■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa21.36■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 A0A1W2PRU2 124 aa21.35■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 GFRA2O00451 464 aa21.35■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 NDUFS3O75489 264 aa21.35■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 CREMQ03060 361 aa21.35■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 TMC8Q8IU68 726 aa21.35■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 SHKBP1Q8TBC3 707 aa21.35■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 ALG14Q96F25 216 aa21.35■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 DCUN1D1Q96GG9 259 aa21.35■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 UBAP1Q9NZ09 502 aa21.35■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 PADI4Q9UM07 663 aa21.35■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 POMPQ9Y244 141 aa21.35■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 MAGEB3O15480 346 aa21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 SRP72O76094 671 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 RHOBTB1O94844 696 aa21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 C8AP07357 584 aa21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 COX4I1P13073 169 aa21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 MC4RP32245 332 aa21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 RALGPS1Q5JS13 557 aa21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 TMEM198Q66K66 360 aa21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 FRMD7Q6ZUT3 714 aa21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 KBTBD6Q86V97 674 aa21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 LPGAT1Q92604 370 aa21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 MARK4Q96L34 752 aa21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 SLX1AQ9BQ83 275 aa21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 CARNS1A5YM72 827 aa21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 KIAA0355O15063 1070 aa21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 STX7O15400 261 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 CXCL14O95715 111 aa21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 ATP6V1B1P15313 513 aa21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 CD1EP15812 388 aa21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 VARSP26640 1264 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 PCSK6P29122 969 aa21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 SLC22A9Q8IVM8 553 aa21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 DCAF4L2Q8NA75 395 aa21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 CCDC68Q9H2F9 335 aa21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 CLEC4EQ9ULY5 219 aa21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 H3BMM5 538 aa21.33■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 H3BNX3 289 aa21.33■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 PDE5AO76074 875 aa21.33■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 CTPS1P17812 591 aa21.33■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 SUOXP51687 545 aa21.33■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa21.33■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 CUZD1Q86UP6 607 aa21.33■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 PIANPQ8IYJ0 282 aa21.33■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 FIBCD1Q8N539 461 aa21.33■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 CATSPER1Q8NEC5 780 aa21.33■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 SLC35B4Q969S0 331 aa21.33■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
MESP1-201ENST00000300057 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 BAIAP3O94812 1187 aa21.33■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 TSPAN8P19075 237 aa21.33■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 CREB5Q02930 508 aa21.33■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 APOFQ13790 326 aa21.33■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 OR4D1Q15615 310 aa21.33■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 EML3Q32P44 896 aa21.33■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 FAM219BQ5XKK7 198 aa21.33■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 TMEM126BQ8IUX1 230 aa21.33■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 FAM217AQ8IXS0 508 aa21.33■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 CORO1BQ9BR76 489 aa21.33■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 LRRC3Q9BY71 257 aa21.33■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 SUPT7LO94864 414 aa21.32■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 BMP1P13497 986 aa21.32■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 PORP16435 677 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 Q6ZNX1 250 aa21.32■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 TTC30BQ8N4P2 665 aa21.32■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 HSPBAP1Q96EW2 488 aa21.32■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 GSTO2Q9H4Y5 243 aa21.32■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 POPDC3Q9HBV1 291 aa21.32■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa21.32■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 PSMD13Q9UNM6 376 aa21.32■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 ALPIP09923 528 aa21.32■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 LINC00271P0C7V0 271 aa21.32■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 IMPDH1P20839 514 aa21.32■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 PIK3R1P27986 724 aa21.32■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 PTPRNQ16849 979 aa21.32■■□□□ 1
MESP1-201ENST00000300057 PAQR3Q6TCH7 311 aa21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms