RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299667.8

ZNF3-202, Transcript of zinc finger protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF3, Length 2,799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3-202ENST00000299667 CNTN5O94779 1100 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 PEX11BO96011 259 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 MMP2P08253 660 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 IDO1P14902 403 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 IL12AP29459 219 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 BRCC3P46736 316 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 CDC42EP1Q00587 391 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 AAK1Q2M2I8 961 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 ARTNQ5T4W7 220 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 MARC1Q5VT66 337 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 GLYATQ6IB77 296 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 UGT3A1Q6NUS8 523 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 ZNF773Q6PK81 442 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 BTLAQ7Z6A9 289 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 LRRTM3Q86VH5 581 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 SFRP1Q8N474 314 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 SLC16A10Q8TF71 515 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 PSMG2Q969U7 264 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 TMBIM1Q969X1 311 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 CDCA5Q96FF9 252 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 PPM1MQ96MI6 270 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 HBEGFQ99075 208 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 DGCR6LQ9BY27 220 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 TRIM54Q9BYV2 358 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 MFSD1Q9H3U5 465 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 SMURF2Q9HAU4 748 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 NTN4Q9HB63 628 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 ARNT2Q9HBZ2 717 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 CPA4Q9UI42 421 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 TRIM43BA6NCK2 446 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 CFAP99D6REC4 459 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 CDC7O00311 574 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 LDB2O43679 373 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 SLC22A3O75751 556 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 GLP2RO95838 553 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 FDXRP22570 491 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 SCNN1GP51170 649 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 NFKB2Q00653 900 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 SELPLGQ14242 412 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 MANEALQ5VSG8 457 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 PAQR3Q6TCH7 311 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 SNX29P2Q8IUI4 249 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 COLGALT2Q8IYK4 626 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 HS3ST5Q8IZT8 346 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 FBXO39Q8N4B4 442 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 NSMCE2Q96MF7 247 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 ATOH8Q96SQ7 321 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 BDH2Q9BUT1 245 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 NMUR1Q9HB89 426 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 GALPQ9UBC7 116 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 RNF112Q9ULX5 631 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 KCNH4Q9UQ05 1017 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 MROH6A6NGR9 719 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 TOR1BO14657 336 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 NOBOXO60393 691 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 XYLBO75191 536 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 IGLV3-25P01717 112 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 THP07101 528 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 MYL3P08590 195 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 CDH3P22223 829 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 FMO4P31512 558 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 GJA5P36382 358 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 RENBPP51606 427 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 ARSFP54793 590 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 MTPNP58546 118 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 LCP2Q13094 533 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 GALNT3Q14435 633 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 SPCS2Q15005 226 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 TSNQ15631 228 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 RGS21Q2M5E4 152 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 BROXQ5VW32 411 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 XAF1Q6GPH4 301 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 SYVN1Q86TM6 617 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 IGFN1Q86VF2 1251 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 TMEM86AQ8N2M4 240 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 TERB1Q8NA31 727 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 OR2T11Q8NH01 316 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF3-202ENST00000299667 SLC22A17Q8WUG5 538 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms