RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 PKMP14618 531 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 ADRA1BP35368 520 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 KIR3DL1P43629 444 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 IDH3AP50213 366 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 CHSY3Q70JA7 882 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 ZBTB2Q8N680 514 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 SEMA3GQ9NS98 782 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 MPP1Q00013 466 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 GBE1Q04446 702 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF354BQ96LW1 612 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 IGFLR1Q9H665 355 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1W2PQH9 124 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 E7ENX8 843 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 LYPLA2O95372 231 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 LIMK2P53671 638 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 TTLL2Q9BWV7 592 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 OR4K2Q8NGD2 314 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 PHF12Q96QT6 1004 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 LRCH4O75427 683 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 IL1BP01584 269 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 RLN1P04808 185 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP4F8P98187 520 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 GCNT6Q5T4J0 391 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXO42Q6P3S6 717 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR65Q8IYL9 337 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 CFAP52Q8N1V2 620 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 OR6K2Q8NGY2 324 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 SDCBP2Q9H190 292 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa24.03■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 CILPO75339 1184 aa24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 MBTD1Q05BQ5 628 aa24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 ENPEPQ07075 957 aa24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 RBBP4Q09028 425 aa24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 SATL1Q86VE3 508 aa24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 MON1AQ86VX9 555 aa24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF248Q8NDW4 579 aa24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 DIRAS2Q96HU8 199 aa24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 TCF25Q9BQ70 676 aa24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 ADGRB1O14514 1584 aa24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM86C2PA6NEL3 165 aa24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 MCIDASD6RGH6 385 aa24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 AP2A1O95782 977 aa24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAJC11Q9NVH1 559 aa24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 KCTD5Q9NXV2 234 aa24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 ELP6Q0PNE2 266 aa24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 PTP4A2Q12974 167 aa24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 SNAPC1Q16533 368 aa24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF730Q6ZMV8 503 aa24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF781Q8N8C0 355 aa24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 GSDMCQ9BYG8 508 aa24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 SNX7Q9UNH6 387 aa24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 CNTNAP1P78357 1384 aa24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 PTGIRP43119 386 aa24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 AHSA2Q719I0 299 aa24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 DAW1Q8N136 415 aa24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 CITED4Q96RK1 184 aa24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 SEC14L3Q9UDX4 400 aa24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 CCNE2O96020 404 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 GPIP06744 558 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 CREMQ03060 361 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 CBX3Q13185 183 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 GPC2Q8N158 579 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 MRIQ9BWK5 157 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 ADGRB2O60241 1585 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 MT-ND1P03886 318 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 AQP4P55087 323 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 ACAP2Q15057 778 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 IL23RQ5VWK5 629 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 NUDT4Q9NZJ9 180 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 B4GALT4O60513 344 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 ITGA3P26006 1051 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 RALGPS1Q5JS13 557 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 P2RY8Q86VZ1 359 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 TDRPQ86YL5 185 aa24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms