RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 MYL3P08590 195 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 SH3BP2P78314 561 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 CLEC20AQ6ZU45 233 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 TAC4Q86UU9 113 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 ABHD11Q8NFV4 315 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 GAD1Q99259 594 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 CD320Q9NPF0 282 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 LATS2Q9NRM7 1088 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 INVSQ9Y283 1065 aa15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 CYBBP04839 570 aa15.21■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 ST13P50502 369 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 VGLL4Q14135 290 aa15.21■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 HORMAD1Q86X24 394 aa15.21■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 MCFD2Q8NI22 146 aa15.21■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 RSPH1Q8WYR4 309 aa15.21■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 TOP1MTQ969P6 601 aa15.21■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 TEPSINQ96N21 525 aa15.21■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 NPY6RQ99463 290 aa15.21■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 FUNDC2Q9BWH2 189 aa15.21■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 SLC39A8Q9C0K1 460 aa15.21■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 VPS28Q9UK41 221 aa15.21■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 BBIP1A8MTZ0 92 aa15.21■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 NDUFB5O43674 189 aa15.21■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 NDUFS2O75306 463 aa15.21■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 IMPDH1P20839 514 aa15.21■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 RPL38P63173 70 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 ACAP2Q15057 778 aa15.21■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 TECRLQ5HYJ1 363 aa15.21■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 TICAM1Q8IUC6 712 aa15.21■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 MCOLN3Q8TDD5 553 aa15.21■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 GPR152Q8TDT2 470 aa15.21■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 BPIFA1Q9NP55 256 aa15.21■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP15.21■□□□□ 0.036e-7■■■□□ 18.5
USP25-201ENST00000285679 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
USP25-201ENST00000285679 DCLK1O15075 740 aa15.21■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 OR4F21O95013 312 aa15.21■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 ANGPTL1O95841 491 aa15.21■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 ANXA6P08133 673 aa15.21■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 PROZP22891 400 aa15.21■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 SLC6A2P23975 617 aa15.21■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 ARSFP54793 590 aa15.21■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 OR4D2P58180 307 aa15.21■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 LILRA4P59901 499 aa15.21■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 ZNF773Q6PK81 442 aa15.21■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 ITIH5Q86UX2 942 aa15.21■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 OSTM1Q86WC4 334 aa15.21■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 MTMR14Q8NCE2 650 aa15.21■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 OR2T12Q8NG77 320 aa15.21■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 LPPQ93052 612 aa15.21■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 PAGE1O75459 146 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 INMTO95050 263 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 AGXTP21549 392 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 ATP6V0D1P61421 351 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 LBX2Q6XYB7 198 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 CLIP4Q8N3C7 705 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 LRRC52Q8N7C0 313 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 SCAMP5Q8TAC9 235 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 CNIH3Q8TBE1 160 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 PCED1BQ96HM7 432 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 SPATA17Q96L03 361 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 GIMAP4Q9NUV9 329 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 TMEM181Q9P2C4 612 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 FBXW11Q9UKB1 542 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 ADAM23O75077 832 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 SERPINB7O75635 380 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 DIRAS1O95057 198 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 MYCP01106 439 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 POMCP01189 267 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 SBK3P0C264 359 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 RFC2P35250 354 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 PLA2G16P53816 162 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 EFEMP1Q12805 493 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 DAG1Q14118 895 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 RIOX2Q8IUF8 465 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 SIX5Q8N196 739 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 KIFC1Q9BW19 673 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 KATNAL1Q9BW62 490 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 C3orf18Q9UK00 162 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 PKP3Q9Y446 797 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 TFECO14948 347 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 CDK14O94921 469 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 AKT1P31749 480 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 DAOAP59103 153 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 COPZ1P61923 177 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 SNX17Q15036 470 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 PTPRNQ16849 979 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 BTLAQ7Z6A9 289 aa15.2■□□□□ 0.02
USP25-201ENST00000285679 EPHX4Q8IUS5 362 aa15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms