RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 ARPC2O15144 300 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 ANXA5P08758 320 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 OR56A5P0C7T3 313 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 HSD17B1P14061 328 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 RING1Q06587 406 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 BCL2L1Q07817 233 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 SGO1Q5FBB7 561 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 SDHAF4Q5VUM1 108 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 FBXL22Q6P050 247 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 TRPV3Q8NET8 790 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 LRRC3Q9BY71 257 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 CEP44Q9C0F1 390 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 ACTR8Q9H981 624 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 INVSQ9Y283 1065 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 RAI2Q9Y5P3 530 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 PRRG1O14668 218 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 SEPT4O43236 478 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 CBFA2T3O75081 653 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 BMP2P12643 396 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 S100A3P33764 101 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 PPP3CCP48454 512 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 NUMBP49757 651 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 EPHB3P54753 998 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 VAC14Q08AM6 782 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 MAPKAPK3Q16644 382 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 AGMOQ6ZNB7 445 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 CHST9Q7L1S5 443 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 ZMIZ2Q8NF64 920 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 RAD18Q9NS91 495 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 RIMS3Q9UJD0 308 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 KAT6AQ92794 2004 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 GRXCR2A6NFK2 248 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 TCAF2A6NFQ2 919 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 J3KR12 359 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 KPNA5O15131 536 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 ULK1O75385 1050 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 F7P08709 466 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 OR4Q2P0C623 313 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 EPB42P16452 691 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 SYTL3Q4VX76 610 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 THAP5Q7Z6K1 395 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 SERINC5Q86VE9 423 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 PLD3Q8IV08 490 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 HID1Q8IV36 788 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 CDC26Q8NHZ8 85 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 RUBCNLQ9H714 662 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 ARL5AQ9Y689 179 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 MYO1GB0I1T2 1018 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 ECI2O75521 394 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 CCNA2P20248 432 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 C16orf72Q14CZ0 275 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 TIGD2Q4W5G0 525 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 C14orf80Q86SX3 495 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 RAET1EQ8TD07 263 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 SLC47A1Q96FL8 570 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 OLFM1Q99784 485 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 PLAC1Q9HBJ0 212 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 TMEM181Q9P2C4 612 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 RPS6KA6Q9UK32 745 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 SIP14410 1827 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 ILVBLA1L0T0 632 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 CACNG3O60359 315 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 FYNP06241 537 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 RAP2AP10114 183 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 GJA5P36382 358 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 PWP1Q13610 501 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 NEDD8Q15843 81 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 CRY1Q16526 586 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 SLC44A4Q53GD3 710 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 LCN8Q6JVE9 175 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 TTC23LQ6PF05 361 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 GALNT13Q8IUC8 556 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 CANT1Q8WVQ1 401 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 OVCA2Q8WZ82 227 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-201ENST00000264345 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms