RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637524.1

U6.99-201, humanhuman

BASIC

Gene U6, Length 83 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U6.99-201ENST00000637524 CD38P28907 300 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 THPOP40225 353 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 P2RX3P56373 397 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 TMPRSS3P57727 454 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 BFSP1Q12934 665 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 Q4G0T1 1027 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 DCST1Q5T197 706 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 ZNF367Q7RTV3 350 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 ADIPOR2Q86V24 386 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 CNGA4Q8IV77 575 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 C7orf57Q8NEG2 295 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 OR1J2Q8NGS2 313 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 THAP6Q8TBB0 222 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 LPGAT1Q92604 370 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 TAAR8Q969N4 342 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 FAM162AQ96A26 154 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 LRRC3BQ96PB8 259 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 SORCS2Q96PQ0 1159 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 GAD1Q99259 594 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 HAUS8Q9BT25 410 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 GPR88Q9GZN0 384 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 C17orf75Q9HAS0 396 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 PLAC1Q9HBJ0 212 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 PCDH9Q9HC56 1237 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 WDR35Q9P2L0 1181 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 STK39Q9UEW8 545 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 RCOR1Q9UKL0 485 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 COG5Q9UP83 839 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 NME7Q9Y5B8 376 aa2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 ADAM10O14672 748 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 KCNN4O15554 427 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 NDUFS4O43181 175 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 SPINT2O43291 252 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 SPRY3O43610 288 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 ITM2AO43736 263 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 PSMD10O75832 226 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 LCATP04180 440 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 CYC1P08574 325 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 VDRP11473 427 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 VPREB1P12018 145 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 CPT2P23786 658 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 HOXC8P31273 242 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 STX2P32856 288 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 KRT2P35908 639 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 RFX2P48378 723 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 ENTPD1P49961 510 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 RAB28P51157 221 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 NUDT6P53370 316 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 LIMK1P53667 647 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 RBP5P82980 135 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 FOXM1Q08050 763 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 MYBPC2Q14324 1141 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 IL11RAQ14626 422 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 COG2Q14746 738 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 PTGR1Q14914 329 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 NR1D2Q14995 579 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 SYT16Q17RD7 645 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 MYLK3Q32MK0 819 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 MMEL1Q495T6 779 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 CCDC184Q52MB2 194 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 EFHC1Q5JVL4 640 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 ARMC4Q5T2S8 1044 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 TMEM198Q66K66 360 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 NUGGCQ68CJ6 796 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 SYCE2Q6PIF2 218 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 FAM198BQ6UWH4 519 aa2.89□□□□□ -1.95
U6.99-201ENST00000637524 Q6ZSV7 163 aa2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms