RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 LEKR1Q6ZMV7 388 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC81Q6ZN84 652 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 TMC3Q7Z5M5 1100 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR48Q8TAF3 677 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 HPCAL4Q9UM19 191 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 SHOC2Q9UQ13 582 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRK1Q38SD2 2015 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 MMP20O60882 483 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 IFNB1P01574 187 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 RPIAP49247 311 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 GDF10P55107 478 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 PTK2BQ14289 1009 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 IZUMO3Q5VZ72 239 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 GLIS1Q8NBF1 620 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 KYQ8NBH2 561 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM248Q9NWD8 314 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PQM1 296 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 NEMP1O14524 444 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 POP4O95707 220 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 ANXA6P08133 673 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 RHOQP17081 205 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 RBL1P28749 1068 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGEA6P43360 314 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 MAPKAPK2P49137 400 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 THOP1P52888 689 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 GALNT2Q10471 571 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 GPS2Q13227 327 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 SPIDRQ14159 915 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 KCTD16Q68DU8 428 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 ACSL6Q9UKU0 697 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 PLD2O14939 933 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNN4O15554 427 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC28A2O43868 658 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 TIMP2P16035 220 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC5A2P31639 672 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 CFAP58Q5T655 872 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 FAXCQ5TGI0 409 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 PPIL6Q8IXY8 311 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 NETO2Q8NC67 525 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 HTR3CQ8WXA8 447 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 GLMNQ92990 594 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 TSGA13Q96PP4 275 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC13A1Q9BZW2 595 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 KLC2Q9H0B6 622 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 PTPN13Q12923 2485 aa24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 MFSD11O43934 449 aa24.1■■□□□ 1.45
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CAPNS1-216ENST00000628306 ETS1P14921 441 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 UGT1A5P35504 534 aa24.1■■□□□ 1.45
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CAPNS1-216ENST00000628306 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 IRF4Q15306 451 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 TGIF1Q15583 401 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 ALG11Q2TAA5 492 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 AFMIDQ63HM1 303 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 LRIG3Q6UXM1 1119 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 GDPD4Q6W3E5 623 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 ARL10Q8N8L6 244 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC74AQ96AQ1 378 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 HDAC11Q96DB2 347 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 VAT1Q99536 393 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGEH1Q9H213 219 aa24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 D6RAR5 112 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 TOR1BO14657 336 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 TM7SF2O76062 418 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 ETFBP38117 255 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 HK3P52790 923 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 CCL7P80098 99 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNC4Q03721 635 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 TTC7BQ86TV6 843 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 NAT8LQ8N9F0 302 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 FATE1Q969F0 183 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 OGFRQ9NZT2 677 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 KDELR3O43731 214 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 TMCC1O94876 653 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 HGFP14210 728 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 VPS41P49754 854 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 WSCD2Q2TBF2 565 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM52BQ4KMG9 183 aa24.08■■□□□ 1.45
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