RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624138.3

LINC00963-218, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00963, Length 261 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-218ENST00000624138 DOK6Q6PKX4 331 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 IGFL3Q6UXB1 125 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 MED25Q71SY5 747 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 PRSS42Q7Z5A4 293 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 NLRP8Q86W28 1048 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 KCNMB4Q86W47 210 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 GALNT13Q8IUC8 556 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 LZTR1Q8N653 840 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 TMEM35BQ8NCS4 154 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 COX14Q96I36 57 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 ELMO2Q96JJ3 720 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 GSDMAQ96QA5 445 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 HERPUD2Q9BSE4 406 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 PLCB1Q9NQ66 1216 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 COPG2Q9UBF2 871 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 CPNE7Q9UBL6 633 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 RTTNQ86VV8 2226 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 DNHD1Q96M86 4753 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 A0A1W2PQ67 120 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 A6NL46 340 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 PRAMEF11O60813 436 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 DIAPH2O60879 1101 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 UBXN7O94888 489 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 STSP08842 583 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 RAB40ALP0C0E4 278 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 BPIP17213 487 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 NELFEP18615 380 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 SLC9A1P19634 815 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 VIPR1P32241 457 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 GPR1P46091 355 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 HDAC4P56524 1084 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 ZNF235Q14590 738 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 CCDC14Q49A88 953 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 TTI2Q6NXR4 508 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 TRIM65Q6PJ69 517 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 Q6ZS92 163 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 TMEM26Q6ZUK4 368 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 Q6ZVL8 140 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 STRADAQ7RTN6 431 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 CCDC185Q8N715 623 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 AVL9Q8NBF6 648 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 NTAN1Q96AB6 310 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 TGM7Q96PF1 710 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 RAB33BQ9H082 229 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 LRRC19Q9H756 370 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 PDE7BQ9NP56 450 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 LATS2Q9NRM7 1088 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 APEX2Q9UBZ4 518 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 EPHA6Q9UF33 1036 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 OSGIN2Q9Y236 505 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 PPIL1Q9Y3C6 166 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-218ENST00000624138 HCFC1P51610 2035 aa7.15□□□□□ -1.27
LINC00963-218ENST00000624138 A0A1B0GUH1 482 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-218ENST00000624138 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-218ENST00000624138 GOLGA8SH3BPF8 625 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-218ENST00000624138 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-218ENST00000624138 E2F3O00716 465 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-218ENST00000624138 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-218ENST00000624138 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-218ENST00000624138 PALMO75781 387 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-218ENST00000624138 GNA14O95837 355 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-218ENST00000624138 PYGLP06737 847 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-218ENST00000624138 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-218ENST00000624138 TYRP1P17643 537 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-218ENST00000624138 AMD1P17707 334 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-218ENST00000624138 CAPN3P20807 821 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-218ENST00000624138 LHCGRP22888 699 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-218ENST00000624138 EPHB2P29323 1055 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-218ENST00000624138 PTPN9P43378 593 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-218ENST00000624138 GLRBP48167 497 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-218ENST00000624138 CLCNKAP51800 687 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-218ENST00000624138 VAV2P52735 878 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-218ENST00000624138 RRADP55042 308 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.8 ms