RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623253.4_PAR_Y

CD99-211, Transcript of CD99 molecule (Xg blood group), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD99, Length 573 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZPBPQ9BS86 351 aa16.06■□□□□ 0.16
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TBC1D29Q9UFV1 150 aa16.06■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KCNK6Q9Y257 313 aa16.06■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PPIL1Q9Y3C6 166 aa16.06■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TTLL3Q9Y4R7 772 aa16.06■□□□□ 0.16
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y FZD6O60353 706 aa16.04■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CLDN7O95471 211 aa16.04■□□□□ 0.16
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y FOXM1Q08050 763 aa16.04■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KRT81Q14533 505 aa16.04■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NLRP8Q86W28 1048 aa16.04■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TBC1D10AQ9BXI6 508 aa16.04■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PRR19A6NJB7 356 aa16.03■□□□□ 0.16
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SLC2A4P14672 509 aa16.03■□□□□ 0.16
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa16.03■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y LYSMD3Q7Z3D4 306 aa16.03■□□□□ 0.16
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TEX26Q8N6G2 289 aa16.03■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y LPCAT1Q8NF37 534 aa16.03■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TRIM11Q96F44 468 aa16.03■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PCDH18Q9HCL0 1135 aa16.03■□□□□ 0.16
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PCDHB3Q9Y5E6 796 aa16.03■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y C1orf232A0A0U1RR37 186 aa16.02■□□□□ 0.16
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SKILP12757 684 aa16.02■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y F3P13726 295 aa16.02■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y DLSTP36957 453 aa16.02■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y STAT5AP42229 794 aa16.02■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SSR1P43307 286 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y EPHA4P54764 986 aa16.02■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KLHL30Q0D2K2 578 aa16.02■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KLRB1Q12918 225 aa16.02■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CCDC122Q5T0U0 273 aa16.02■□□□□ 0.16
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y HERPUD2Q9BSE4 406 aa16.02■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ULBP3Q9BZM4 244 aa16.02■□□□□ 0.16
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CPNE7Q9UBL6 633 aa16.02■□□□□ 0.16
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CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa16.02■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa16.02■□□□□ 0.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y FLNCQ14315 2725 aa16.01■□□□□ 0.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GRID2O43424 1007 aa16.01■□□□□ 0.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KATNA1O75449 491 aa16.01■□□□□ 0.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y DLGAP3O95886 979 aa16.01■□□□□ 0.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NR1D1P20393 614 aa16.01■□□□□ 0.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CA4P22748 312 aa16.01■□□□□ 0.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZNF165P49910 485 aa16.01■□□□□ 0.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GFERP55789 205 aa16.01■□□□□ 0.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MMRN1Q13201 1228 aa16.01■□□□□ 0.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ERV3-1Q14264 604 aa16.01■□□□□ 0.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y IHHQ14623 411 aa16.01■□□□□ 0.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ATCAYQ86WG3 371 aa16.01■□□□□ 0.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PHYKPLQ8IUZ5 450 aa16.01■□□□□ 0.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y LURAP1LQ8IV03 231 aa16.01■□□□□ 0.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y FAM26EQ8N5C1 309 aa16.01■□□□□ 0.15
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