RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 PLD3Q8IV08 490 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 C7orf31Q8N865 590 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 FLCNQ8NFG4 579 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 URGCPQ8TCY9 931 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 PIK3R3Q92569 461 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 SNAPC3Q92966 411 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 NEDD4LQ96PU5 975 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 TWNKQ96RR1 684 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 YME1L1Q96TA2 773 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 AS3MTQ9HBK9 375 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 CPNE5Q9HCH3 593 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 CNTN6Q9UQ52 1028 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 VWA7Q9Y334 891 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 IQCF3P0C7M6 154 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 PIGAP37287 484 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 SLC12A2P55011 1212 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 PLIN5Q00G26 463 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 BNIP2Q12982 314 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 PRKAA1Q13131 559 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 TFDP2Q14188 446 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 ATF7IP2Q5U623 682 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 FAM160B1Q5W0V3 765 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 XYLT1Q86Y38 959 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 KDM1BQ8NB78 822 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 OR13J1Q8NGT2 312 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 RHOXF1Q8NHV9 184 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 CNIH3Q8TBE1 160 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 APBB2Q92870 758 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 TBATAQ96M53 351 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 FEM1AQ9BSK4 669 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 CD320Q9NPF0 282 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 ARMC1Q9NVT9 282 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 QPCTLQ9NXS2 382 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM181Q9P2C4 612 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 SLC12A8A0AV02 714 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 HUS1O60921 280 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 MICAL2O94851 1124 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 PGRP06401 933 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 NFICP08651 508 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 SBK3P0C264 359 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 PRKACGP22612 351 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 GSTM2P28161 218 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 GP5P40197 560 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 ETV3P41162 512 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 ASPAP45381 313 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 EFNA5P52803 228 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 PON2Q15165 354 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 TBRG1Q3YBR2 411 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 AGAP6Q5VW22 663 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 SPRED1Q7Z699 444 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 PCDH19Q8TAB3 1148 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM74Q96NL1 305 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 AGAP4Q96P64 663 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 RNF157Q96PX1 679 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 LGMNQ99538 433 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 BTBD2Q9BX70 525 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 TMLHEQ9NVH6 421 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 XPR1Q9UBH6 696 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 TEKT2Q9UIF3 430 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 PDE10AQ9Y233 779 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 DOCK3Q8IZD9 2030 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 ADGRA2Q96PE1 1338 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 APOL1O14791 398 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 DLX3O60479 287 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 MSCO60682 206 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 FADS2O95864 444 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 LDLRP01130 860 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 COL6A1P12109 1028 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 TPH1P17752 444 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 GPD1P21695 349 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 CNTFP26441 200 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 FMO3P31513 532 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 CD83Q01151 205 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 GHRHRQ02643 423 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 CD47Q08722 323 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 POU6F1Q14863 301 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 SYT16Q17RD7 645 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 STXBP5Q5T5C0 1151 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 DCAF15Q66K64 600 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 ZPBP2Q6X784 338 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 THAP5Q7Z6K1 395 aa8.16□□□□□ -1.1
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