RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 RAD1O60671 282 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 CLDN7O95471 211 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 CYP1A2P05177 515 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 DPYSL3Q14195 570 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 ANKS6Q68DC2 871 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 ARRDC2Q8TBH0 407 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 TSGA13Q96PP4 275 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 WDR24Q96S15 920 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 LYSMD1Q96S90 227 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 ZMYND15Q9H091 742 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 TBC1D29Q9UFV1 150 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 PILRAQ9UKJ1 303 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 PRKAB1Q9Y478 270 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 FLNCQ14315 2725 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 MYO1FO00160 1098 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 CCNCP24863 283 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 RPL26P61254 145 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 HHEXQ03014 270 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 SPRY4Q9C004 299 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 HAUS2Q9NVX0 235 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 TTLL3Q9Y4R7 772 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRF-216ENST00000617451 CA4P22748 312 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 SSR1P43307 286 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 MC2RQ01718 297 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 NIPAL4Q0D2K0 466 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 HADHQ16836 314 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 SNAP47Q5SQN1 464 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 IYDQ6PHW0 289 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 RTP4Q96DX8 246 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 PCDH9Q9HC56 1237 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PQJ5 194 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 A6NCN8 305 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 A8MU76 341 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 SERPINC1P01008 464 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 SPINT3P49223 89 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 POLE2P56282 527 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 NFATC2Q13469 925 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 LPCAT1Q8NF37 534 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 SH3KBP1Q96B97 665 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 SLC45A3Q96JT2 553 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 RMI1Q9H9A7 625 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 A0A087X0T9 212 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 FADS2P1A8MWK0 482 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 SERPING1P05155 500 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 HLA-DQB2P05538 268 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 FAM228BP0C875 321 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 KCNAB2Q13303 367 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 NCSTNQ92542 709 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 CATSPER2Q96P56 530 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF670Q9BS34 389 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 HERPUD2Q9BSE4 406 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 FAM83DQ9H4H8 585 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 FBXO8Q9NRD0 319 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 TUBD1Q9UJT1 453 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 KCNK6Q9Y257 313 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 RGSL1A5PLK6 1076 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 ACP5P13686 325 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 EPHA4P54764 986 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 IQCB1Q15051 598 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 QPCTQ16769 361 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 CEACAM20Q6UY09 585 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 SLC9B2Q86UD5 537 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 CPNE8Q86YQ8 564 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 NLGN4XQ8N0W4 816 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 KCTD6Q8NC69 237 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 LRRN4Q8WUT4 740 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 CTRCQ99895 268 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 ZPBPQ9BS86 351 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 SLC2A4P14672 509 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 PBX1P40424 430 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 CCR10P46092 362 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 GBE1Q04446 702 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 TLE1Q04724 770 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 PDK2Q15119 407 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRF-216ENST00000617451 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
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