RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 URB1O60287 2271 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 C5orf51A6NDU8 294 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 LTKP29376 864 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 LSM3P62310 102 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ITGA7Q13683 1181 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM119Q4V9L6 283 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 RNF180Q86T96 592 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 KAT2BQ92831 832 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PSKH2Q96QS6 385 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CDH22Q9UJ99 828 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 FADS3Q9Y5Q0 445 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 NUP205Q92621 2012 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 OR10H2O60403 315 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 KDELR1P24390 212 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 GRK5P34947 590 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 GRIA2P42262 883 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PSEN1P49768 467 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 TEAD4Q15561 434 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 E7ENX8 843 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 AP5Z1O43299 807 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 IPO13O94829 963 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 TYMPP19971 482 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 FAPQ12884 760 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 AARDQ4LEZ3 155 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 LGR4Q9BXB1 951 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 NTRK1P04629 796 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 URODP06132 367 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SLC13A2Q13183 592 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 DUPD1Q68J44 220 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SPESP1Q6UW49 350 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CLNKQ7Z7G1 428 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SPATA22Q8NHS9 363 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 MYNNQ9NPC7 610 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 TSPAN1O60635 241 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 FGBP02675 491 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 YAP1P46937 504 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PGDP52209 483 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 THOP1P52888 689 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 MAZP56270 477 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 BST1Q10588 318 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 NANSQ9NR45 359 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ISPDA4D126 451 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PCDHGA12O60330 932 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 GPIP06744 558 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 RHOCP08134 193 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PLEKHG6Q3KR16 790 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 FOXR2Q6PJQ5 311 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PGAM4Q8N0Y7 254 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CERKQ8TCT0 537 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PRRG4Q9BZD6 226 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 FADS2P1A8MWK0 482 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SLC22A1O15245 554 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PGRP06401 933 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 GSTT2P0CG29 244 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 EPHB3P54753 998 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SLC12A3P55017 1021 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 RELL1Q8IUW5 271 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CPNE9Q8IYJ1 553 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 DSELQ8IZU8 1212 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 TAS1R2Q8TE23 839 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ACTR6Q9GZN1 396 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CALML5Q9NZT1 146 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 C21orf2O43822 256 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 MT-CO2P00403 227 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 MAGEA6P43360 314 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SCGB2A2Q13296 93 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 OR5J2Q8NH18 312 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF606Q8WXB4 792 aa6.95□□□□□ -1.3
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