RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 RELL1Q8IUW5 271 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 FBF1Q8TES7 1133 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 CEP44Q9C0F1 390 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 MYLK2Q9H1R3 596 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 TRABDQ9H4I3 376 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 VPS37BQ9H9H4 285 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 FZD4Q9ULV1 537 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 CST8O60676 142 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 BANF1O75531 89 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 UNC5CO95185 931 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 IFNB1P01574 187 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 ABHD2P08910 425 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 PIRTP0C851 137 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 TIMP2P16035 220 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 GARSP41250 739 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 BNIP3Q12983 259 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 ZBTB17Q13105 803 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 TOMM20Q15388 145 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 PPM1JQ5JR12 505 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 RFLNAQ6ZTI6 216 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 ZBED8Q8IZ13 594 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 TMIEQ8NEW7 156 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 OR13H1Q8NG92 308 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM237Q96Q45 408 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 SEMA3CQ99985 751 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC39A3Q9BRY0 314 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 FBRSQ9HAH7 460 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 PCDH12Q9NPG4 1184 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 FADS3Q9Y5Q0 445 aa12.53□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 GOLGA8MH3BSY2 632 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PIAS1O75925 651 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 CCNB1P14635 433 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 ITGB7P26010 798 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SMUG1Q53HV7 270 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 MARC1Q5VT66 337 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 VSIG1Q86XK7 387 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PELI3Q8N2H9 469 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 GRID1Q9ULK0 1009 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PHTF1Q9UMS5 762 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 HLA-DQB2P05538 268 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 CA4P22748 312 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 CETN2P41208 172 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 HCAR3P49019 387 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SESN3P58005 492 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 IL10RBQ08334 325 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 WASHC5Q12768 1159 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 TRAF2Q12933 501 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 MPP3Q13368 585 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF284Q2VY69 593 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 MAP7D3Q8IWC1 876 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 GRAMD1AQ96CP6 724 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP1R16AQ96I34 528 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF670Q9BS34 389 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SUV39H2Q9H5I1 410 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 DLL3Q9NYJ7 618 aa12.52□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 CCND1P24385 295 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 CD38P28907 300 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 C21orf59P57076 290 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 MTM1Q13496 603 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SPARCL1Q14515 664 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 PCSK7Q16549 785 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 UGP2Q16851 508 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 TSPAN33Q86UF1 283 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 NACC2Q96BF6 587 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SMC6Q96SB8 1091 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM121Q9BTD3 319 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SCUBE2Q9NQ36 999 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 CD84Q9UIB8 345 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 SCML1Q9UN30 329 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 CHKBQ9Y259 395 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 ACACAQ13085 2346 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 ANKRD36A6QL64 1941 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 APC2O95996 2303 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 APOL1O14791 398 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 CASC3O15234 703 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 TJP3O95049 919 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 GSRP00390 522 aa12.51□□□□□ -0.41
RABGEF1-209ENST00000607882 FOSL1P15407 271 aa12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms