RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAPRE2Q15555 327 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C6orf10Q5SRN2 563 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIAA1841Q6NSI8 718 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RHEBL1Q8TAI7 183 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PEX13Q92968 403 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLCO4A1Q96BD0 722 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TEX37Q96LM6 180 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC22A12Q96S37 553 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EPS15L1Q9UBC2 864 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 POLG2Q9UHN1 485 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF225Q9UK10 706 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 APPL1Q9UKG1 709 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AP4S1Q9Y587 144 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C5orf42Q9H799 3197 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SCN5AQ14524 2016 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KERAO60938 352 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CLDN11O75508 207 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PENKP01210 267 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 F11P03951 625 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COL6A1P12109 1028 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CES1P23141 567 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARMC3Q5W041 872 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IYDQ6PHW0 289 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TICAM1Q8IUC6 712 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CRIPAKQ8N1N5 446 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BTBD9Q96Q07 612 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDK15Q96Q40 435 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HBEGFQ99075 208 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CD300AQ9UGN4 299 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EGFL7Q9UHF1 273 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BCAP29Q9UHQ4 241 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SNX13Q9Y5W8 968 aa11.73□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LCHNA4D1U4 455 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMCC1O94876 653 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR6B1O95007 311 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FGF4P08620 206 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ETS2P15036 469 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CTPS1P17812 591 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LPOP22079 712 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HK3P52790 923 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RAD51Q06609 339 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LAMB3Q13751 1172 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADGRF1Q5T601 910 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KANK2Q63ZY3 851 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AFTPHQ6ULP2 937 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TAS2R42Q7RTR8 314 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CPNE9Q8IYJ1 553 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SEPT8Q92599 483 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DLG3Q92796 817 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 VPS33AQ96AX1 596 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EME1Q96AY2 570 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EID2BQ96D98 161 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CLSTN3Q9BQT9 956 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DERL2Q9GZP9 239 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SYTL2Q9HCH5 934 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM181Q9P2C4 612 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ILVBLA1L0T0 632 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GOLGA8CPA6NN73 597 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF839A8K0R7 811 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 K7ERQ8 282 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CRCPO75575 148 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSPAN12O95859 305 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RHDQ02161 417 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LCP2Q13094 533 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPS6KA2Q15349 733 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TAF12Q16514 161 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LIN52Q52LA3 116 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CTSL3PQ5NE16 218 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC8B1Q6J4K2 584 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SATL1Q86VE3 508 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HERC6Q8IVU3 1022 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM126BQ8IXS8 530 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CARNMT1Q8N4J0 409 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TM6SF2Q9BZW4 377 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SARDHQ9UL12 918 aa11.72□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C7orf72A4D263 438 aa11.71□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NME4O00746 187 aa11.71□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STX7O15400 261 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ALPIP09923 528 aa11.71□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GRIA3P42263 894 aa11.71□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GRM2Q14416 872 aa11.71□□□□□ -0.53
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MTX3Q5HYI7 312 aa11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms