RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	PKP1	Q13835	747 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ACKR1	Q16570	336 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ACCSL	Q4AC99	568 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	CD163	Q86VB7	1156 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	POLD4	Q9HCU8	107 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	OR1A2	Q9Y585	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772		H0YCG3	227 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	RASGRF2	O14827	1237 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	LMX1B	O60663	402 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	HIP1R	O75146	1068 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ONECUT2	O95948	504 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	JCHAIN	P01591	159 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SP1	P08047	785 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	CD63	P08962	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	MYBL2	P10244	700 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SRC	P12931	536 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	GART	P22102	1010 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	RPA1	P27694	616 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ACOT2	P49753	483 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	NR1H2	P55055	460 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	NUP107	P57740	925 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	KRT85	P78386	507 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SORD	Q00796	357 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	HHEX	Q03014	270 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	OLIG2	Q13516	323 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	NPY5R	Q15761	445 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ARSI	Q5FYB1	569 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	CHST14	Q8NCH0	376 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	CPT1B	Q92523	772 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ALG14	Q96F25	216 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	HPDL	Q96IR7	371 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	FRMD6	Q96NE9	622 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	LGR4	Q9BXB1	951 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	MMP27	Q9H306	513 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SNX25	Q9H3E2	840 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	UCK1	Q9HA47	277 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	OGFR	Q9NZT2	677 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ITM2B	Q9Y287	266 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772		C9J4A7	227 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	FOLR1	P15328	257 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	TRIM23	P36406	574 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	GGCX	P38435	758 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	FOLR3	P41439	243 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	NCKAP1L	P55160	1127 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	MAP3K7CL	P57077	242 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	TUBB4B	P68371	445 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	PMPCA	Q10713	525 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	CUL4A	Q13619	759 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	TUBB2A	Q13885	445 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MSI2-216	ENST00000582772	GALNT17	Q6IS24	598 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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