RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRIM68Q6AZZ1 485 aa28.27■■■□□ 2.12
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CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC22A9Q8IVM8 553 aa28.27■■■□□ 2.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 CHST14Q8NCH0 376 aa28.27■■■□□ 2.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 KCNJ9Q92806 393 aa28.27■■■□□ 2.12
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CTDNEP1-210ENST00000574322 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CDH19Q9H159 772 aa28.26■■■□□ 2.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC8A2Q9UPR5 921 aa28.26■■■□□ 2.12
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CTDNEP1-210ENST00000574322 KDM1BQ8NB78 822 aa28.23■■■□□ 2.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 SORCS1Q8WY21 1168 aa28.23■■■□□ 2.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 SGF29Q96ES7 293 aa28.23■■■□□ 2.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 GPR21Q99679 349 aa28.23■■■□□ 2.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa28.23■■■□□ 2.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 CHRNGP07510 517 aa28.23■■■□□ 2.11
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