RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 PSMC3P17980 439 aa28.93■■■□□ 2.22
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ARHGEF7Q14155 803 aa28.93■■■□□ 2.22
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF805Q5CZA5 627 aa28.93■■■□□ 2.22
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CTDNEP1-208ENST00000573600 UPK3BL2E5RIL1 263 aa28.91■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 NPHS1O60500 1241 aa28.91■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 CTSLP07711 333 aa28.91■■■□□ 2.22
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CTDNEP1-208ENST00000573600 POMKQ9H5K3 350 aa28.91■■■□□ 2.22
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CTDNEP1-208ENST00000573600 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa28.91■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 COL4A3Q01955 1670 aa28.91■■■□□ 2.22
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ZBTB14O43829 449 aa28.9■■■□□ 2.22
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CTDNEP1-208ENST00000573600 LAMP2P13473 410 aa28.9■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 CHRM3P20309 590 aa28.9■■■□□ 2.22
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CTDNEP1-208ENST00000573600 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SKA1Q96BD8 255 aa28.89■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 PTERQ96BW5 349 aa28.89■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM136AQ96C01 138 aa28.89■■■□□ 2.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 ULK4Q96C45 1275 aa28.89■■■□□ 2.22
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