RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572445.1

PRPF8-204, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-204ENST00000572445 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.36□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 SCN8AQ9UQD0 1980 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 IGLON5A6NGN9 336 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 FAM227AF5H4B4 570 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 H3BML4 177 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 K7ESM1 405 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 MCF2LO15068 1137 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 SLC7A4O43246 635 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 SLC28A2O43868 658 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 MAGEC1O60732 1142 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 CLDN11O75508 207 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 UBXN7O94888 489 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 PRNPP04156 253 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 PCCBP05166 539 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 ALPPL2P10696 532 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 SLC2A3P11169 496 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 ADRB3P13945 408 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 TGM2P21980 687 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 CD40P25942 277 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 THOP1P52888 689 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
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PRPF8-204ENST00000572445 TMPRSS3P57727 454 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 KRT83P78385 493 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 SLC6A3Q01959 620 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 CFHR1Q03591 330 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 EXOC3L4Q17RC7 722 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 EFHC1Q5JVL4 640 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 TRNP1Q6NT89 227 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 LRRC31Q6UY01 552 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 USP45Q70EL2 814 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 VASH2Q86V25 355 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 MFSD4AQ8N468 514 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 WDTC1Q8N5D0 677 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 DCAF4L2Q8NA75 395 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 KYQ8NBH2 561 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 OR2A12Q8NGT7 310 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 SLC20A1Q8WUM9 679 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 CPA5Q8WXQ8 436 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 AZIN2Q96A70 460 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 ALG14Q96F25 216 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 PPP1R16AQ96I34 528 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 CCDC138Q96M89 665 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 NCAPGQ9BPX3 1015 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 C11orf70Q9BRQ4 267 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 MAGEB5Q9BZ81 275 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 WDCPQ9H6R7 721 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 MOSPD1Q9UJG1 213 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 TCFL5Q9UL49 500 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 STAP1Q9ULZ2 295 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 U3KQA8 63 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 SPTA1P02549 2419 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 TMEM82A0PJX8 343 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 RASA4BC9J798 803 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 P4HA2O15460 535 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 AQP9O43315 295 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 RASA4O43374 803 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 PIGNO95427 931 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 GNA14O95837 355 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 MMEP08473 750 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 C1SP09871 688 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 ACP1P24666 158 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 PON1P27169 355 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 RXRGP48443 463 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 PRIM2P49643 509 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 KLK7P49862 253 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 ARF5P84085 180 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 SGCGQ13326 291 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 SLC12A1Q13621 1099 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 FZD2Q14332 565 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 RTP5Q14D33 572 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 IRF4Q15306 451 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 FAXCQ5TGI0 409 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 CCDC70Q6NSX1 233 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 LVRNQ6Q4G3 990 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 PCSK4Q6UW60 755 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 NPNTQ6UXI9 565 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 SLC26A9Q7LBE3 791 aa6.34□□□□□ -1.39
PRPF8-204ENST00000572445 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa6.34□□□□□ -1.39
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