RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	SLC29A1	Q99808	456 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CCT7	Q99832	543 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	C2orf81	A6NN90	581 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	MLYCD	O95822	493 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	PIRT	P0C851	137 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CES1	P23141	567 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	NME5	P56597	212 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	TUBA4A	P68366	448 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	PRKCQ	Q04759	706 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CRHR2	Q13324	411 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CYTH1	Q15438	398 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	HM13	Q8TCT9	377 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		18.32	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	DYTN	A2CJ06	578 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00032	P0C843	101 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	FCGR1A	P12314	374 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	SLC6A2	P23975	617 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	PSMA3	P25788	255 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	FMO4	P31512	558 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	GNA12	Q03113	381 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	LGI2	Q8N0V4	545 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	ETAA1	Q9NY74	926 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PP18	115 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559		H3BNH8	94 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	FXYD1	O00168	92 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	GIPC1	O14908	333 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	TLR5	O60602	858 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	ECI2	O75521	394 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	GPI	P06744	558 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CD9	P21926	228 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	FAS	P25445	335 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	KCNK10	P57789	538 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	IL31	Q6EBC2	164 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	RMDN1	Q96DB5	314 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	KCNA7	Q96RP8	456 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	AURKC	Q9UQB9	309 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	FAM50B	Q9Y247	325 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	AK5	Q9Y6K8	562 aa		18.31	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	VPS26A	O75436	327 aa		18.3	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	ASL	P04424	464 aa		18.3	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CYBB	P04839	570 aa		18.3	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	PRR35	P0CG20	571 aa		18.3	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	C7	P10643	843 aa		18.3	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	UROS	P10746	265 aa		18.3	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	COL6A1	P12109	1028 aa		18.3	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	GPR17	Q13304	367 aa		18.3	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		18.3	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	TFAP2C	Q92754	450 aa		18.3	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	LRCH3	Q96II8	777 aa		18.3	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		18.3	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		18.3	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CMTM6	Q9NX76	183 aa		18.3	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		18.3	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	INSIG1	O15503	277 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	KLK8	O60259	260 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	ESRRB	O95718	433 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CKB	P12277	381 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CKMT2	P17540	419 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	TTPA	P49638	278 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CDH4	P55283	916 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	ARPP19	P56211	112 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	RCAN2	Q14206	197 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		18.29	■□□□□ 0.52
RRN3-205	ENST00000563559	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		18.29	■□□□□ 0.52

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