RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	21.61	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		21.61	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		21.61	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF711	Q9Y462	761 aa		21.61	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		21.6	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	PJA2	O43164	708 aa		21.6	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	B4GAT1	O43505	415 aa		21.6	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	21.6	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	DCDC1	P59894	354 aa		21.6	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	COPS2	P61201	443 aa		21.6	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	21.6	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	ATM	Q13315	3056 aa		21.6	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	LRP8	Q14114	963 aa		21.6	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	KDELC1	Q6UW63	502 aa		21.6	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		21.6	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		21.6	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF567	Q8N184	647 aa		21.6	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR26	Q8NDV2	337 aa		21.6	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		21.6	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	HAUS1	Q96CS2	278 aa		21.6	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	VAT1	Q99536	393 aa		21.6	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		21.6	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		21.6	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	UBP1	Q9NZI7	540 aa		21.6	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	21.6	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		21.59	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		21.59	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	HACD1	B0YJ81	288 aa		21.59	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		21.59	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	PMPCB	O75439	489 aa		21.59	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	21.59	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	APOC2	P02655	101 aa		21.59	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	NFKB1	P19838	968 aa		21.59	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	ACTR1B	P42025	376 aa		21.59	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	ACTR1A	P61163	376 aa		21.59	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	PEX6	Q13608	980 aa		21.59	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		21.59	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		21.59	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		21.59	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		21.59	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		21.59	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	THSD1	Q9NS62	852 aa		21.59	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		21.59	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		21.59	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		21.59	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	KALRN	O60229	2985 aa		21.58	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		21.58	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	AURKA	O14965	403 aa		21.58	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	ASMTL	O95671	621 aa		21.58	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	EPO	P01588	193 aa		21.58	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	CTNNA2	P26232	953 aa		21.58	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	21.58	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	PTPN7	P35236	360 aa		21.58	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	21.58	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	VAV2	P52735	878 aa		21.58	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	INHBC	P55103	352 aa		21.58	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	TLE3	Q04726	772 aa		21.58	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		21.58	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	21.58	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	XRCC4	Q13426	336 aa		21.58	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	21.58	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		21.58	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM74	Q96NL1	305 aa		21.58	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	FCRL5	Q96RD9	977 aa		21.58	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	21.58	■■□□□ 1.05
PPP4C-205	ENST00000563200	PPM1D	O15297	605 aa		21.57	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	WNT3A	P56704	352 aa		21.57	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	NOMO1	Q15155	1222 aa		21.57	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	CLEC14A	Q86T13	490 aa		21.57	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		21.57	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	21.57	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		21.57	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		21.57	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	PRORY	Q9H606	182 aa		21.57	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	RMI1	Q9H9A7	625 aa		21.57	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	21.57	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		21.57	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		21.57	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		21.57	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		21.56	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	PLD2	O14939	933 aa		21.56	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	NUAK1	O60285	661 aa		21.56	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	TNFSF15	O95150	251 aa		21.56	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	EML2	O95834	649 aa		21.56	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	ITGA2B	P08514	1039 aa		21.56	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	BPI	P17213	487 aa		21.56	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR3	P46089	330 aa		21.56	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	OR1D5	P58170	312 aa		21.56	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		21.56	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	PID1	Q7Z2X4	250 aa		21.56	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		21.56	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	ALG3	Q92685	438 aa		21.56	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		21.56	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		21.56	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	CARD9	Q9H257	536 aa		21.56	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		21.56	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	RAD18	Q9NS91	495 aa		21.56	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		21.56	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		21.56	■■□□□ 1.04
PPP4C-205	ENST00000563200	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		21.56	■■□□□ 1.04

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