RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 DTHD1Q6ZMT9 781 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 RTL4Q6ZR62 310 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 MIER3Q7Z3K6 550 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 SPRED2Q7Z698 418 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 CPLX4Q7Z7G2 160 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 ARMC8Q8IUR7 673 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 CNGA4Q8IV77 575 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 LINC00518Q8N0U6 118 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 SLC25A41Q8N5S1 370 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 FAM181AQ8N9Y4 354 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 RCBTB1Q8NDN9 531 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 OR8J2Q8NGG1 315 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 EXD1Q8NHP7 514 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 AFG1LQ8WV93 481 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 KCNE4Q8WWG9 221 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 MUL1Q969V5 352 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 ANKRD27Q96NW4 1050 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 FANCD2OSQ96PS1 177 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 PNKPQ96T60 521 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 EFHD1Q9BUP0 239 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 HEMGNQ9BXL5 484 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 OR51B5Q9H339 312 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 SP140LQ9H930 580 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 VCX3AQ9NNX9 186 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 TMEM140Q9NV12 185 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 ENOPH1Q9UHY7 261 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 TINAGQ9UJW2 476 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 GGA2Q9UJY4 613 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 OGDHLQ9ULD0 1010 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa5.51□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 ADAMTSL3P82987 1691 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 DISP2A7MBM2 1401 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 RIC1Q4ADV7 1423 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 MEGF6O75095 1541 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 A0A075B6Q4 140 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 A8MV72 311 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 H0Y858 1186 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 WRBO00258 174 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 DCLK1O15075 740 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 MATN3O15232 486 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 PI15O43692 258 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 NOBOXO60393 691 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 DNAJB6O75190 326 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 FAM155BO75949 473 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 PDE5AO76074 875 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 CCNB2O95067 398 aa5.5□□□□□ -1.53
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CAPN3-211ENST00000562199 C22orf31O95567 290 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 CHEK2O96017 543 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 CAPN1P07384 714 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 MMP2P08253 660 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 RAB4AP20338 218 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 CALB2P22676 271 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 PTAFRP25105 342 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 HTR1BP28222 390 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 CD1BP29016 333 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 PTPN6P29350 595 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 CDC25AP30304 524 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 SHMT1P34896 483 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 BMPR1AP36894 532 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 SLC1A1P43005 524 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 ALDH3B1P43353 468 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 MAGEA11P43364 429 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 CCR10P46092 362 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 LSSP48449 732 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 SLC26A2P50443 739 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 RAP1GDS1P52306 607 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 ADKP55263 362 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 RAB4BP61018 213 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 ACTR3P61158 418 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 VSNL1P62760 191 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 ADAM17P78536 824 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 AMPD2Q01433 879 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 ID3Q02535 119 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 SPIRE1Q08AE8 756 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 FZD5Q13467 585 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 ART3Q13508 389 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 SLC12A1Q13621 1099 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 TNFAIP1Q13829 316 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 PTK6Q13882 451 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 MTF1Q14872 753 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 TMEM132BQ14DG7 1078 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 AOC3Q16853 763 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 PLA1AQ53H76 456 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF628Q5EBL2 1059 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 MANEAQ5SRI9 462 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 MARCH8Q5T0T0 291 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 C6orf183Q5T699 404 aa5.5□□□□□ -1.53
CAPN3-211ENST00000562199 ARHGEF16Q5VV41 709 aa5.5□□□□□ -1.53
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