RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 SLC5A6Q9Y289 635 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 ESPL1Q14674 2120 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 DFFAO00273 331 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 SPAG6O75602 509 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 CLDN1O95832 211 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 LDLRP01130 860 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 FGF5P12034 268 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 ZNF30P17039 623 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 LHCGRP22888 699 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 RPS15P62841 145 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 FMO1Q01740 532 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 ARMC12Q5T9G4 340 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 SYVN1Q86TM6 617 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 TTC13Q8NBP0 860 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 SLC30A5Q8TAD4 765 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 FCRL4Q96PJ5 515 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 NUDCD1Q96RS6 583 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 CNPY3Q9BT09 278 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 TRIM55Q9BYV6 548 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 BRD8Q9H0E9 1235 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 ABCG8Q9H221 673 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 ACTL8Q9H568 366 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 PDE7BQ9NP56 450 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 CPNE7Q9UBL6 633 aa11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 PES1O00541 588 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 RASSF9O75901 435 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 UBXN7O94888 489 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 EML2O95834 649 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 SOD1P00441 154 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 AMD1P17707 334 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 SEPHS1P49903 392 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 CCL11P51671 97 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 PDE1BQ01064 536 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 C1QL3Q5VWW1 255 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 DNAJC24Q6P3W2 148 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 PRSS42Q7Z5A4 293 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 RHOT1Q8IXI2 618 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 CT55Q8WUE5 264 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 SLC20A1Q8WUM9 679 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 NSMCE1Q8WV22 266 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 COX14Q96I36 57 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 ING2Q9H160 280 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 TBC1D29Q9UFV1 150 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 AP4E1Q9UPM8 1137 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 PPIL1Q9Y3C6 166 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 SNX2O60749 519 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 DNAJC6O75061 913 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 GFPT2O94808 682 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 PGLSO95336 258 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 VIPP01282 170 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 UNGP13051 313 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 ACP5P13686 325 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 ERCC2P18074 760 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 PTPN4P29074 926 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 GFERP55789 205 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 PTP4A2Q12974 167 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 SYCP1Q15431 976 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 LRRC66Q68CR7 880 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 TMEM26Q6ZUK4 368 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 RFX8Q6ZV50 586 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 TRIM74Q86UV6 250 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 TRIM48Q8IWZ4 208 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 FNIP1Q8TF40 1166 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 PNPLA2Q96AD5 504 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 ZDHHC12Q96GR4 267 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 ELMO2Q96JJ3 720 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 MCEEQ96PE7 176 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 TGM7Q96PF1 710 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 MGME1Q9BQP7 344 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 CD84Q9UIB8 345 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 KCNK6Q9Y257 313 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-228ENST00000551473 ARGFXA6NJG6 315 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-228ENST00000551473 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms