RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549340.5

LETMD1-218, Transcript of LETM1 domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene LETMD1, Length 818 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1-218ENST00000549340 PTERQ96BW5 349 aa14.56□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 LRIG1Q96JA1 1093 aa14.56□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 MRGPRX3Q96LB0 322 aa14.56□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 ATOH8Q96SQ7 321 aa14.56□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 GPR21Q99679 349 aa14.56□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 HEPHQ9BQS7 1158 aa14.56□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa14.56□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa14.56□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 ALG9Q9H6U8 611 aa14.56□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 COG4Q9H9E3 785 aa14.56□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 TRPV4Q9HBA0 871 aa14.56□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 SYCE1LA8MT33 242 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 CLDN7O95471 211 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 PRAMEF1O95521 474 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 ZNF30P17039 623 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 BPIP17213 487 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 SP100P23497 879 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 FSHRP23945 695 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 DGKGP49619 791 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 KCNJ2P63252 427 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 NFATC2Q13469 925 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 RIPK1Q13546 671 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 PTPRRQ15256 657 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 TMEM215Q68D42 235 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 CYB5D1Q6P9G0 228 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 CRTC1Q6UUV9 634 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 GDPD4Q6W3E5 623 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 FRMD7Q6ZUT3 714 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 TTC7BQ86TV6 843 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 SERPINA9Q86WD7 417 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 NPAS3Q8IXF0 933 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 KDM1BQ8NB78 822 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 VN1R2Q8NFZ6 395 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 OR2A12Q8NGT7 310 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 FRS2Q8WU20 508 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 SMARCD2Q92925 531 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 PPP2R3CQ969Q6 453 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 SGF29Q96ES7 293 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 ASB16Q96NS5 453 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 IL26Q9NPH9 171 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 GDE1Q9NZC3 331 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 TAGLN3Q9UI15 199 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 MSRAQ9UJ68 235 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 GNPTGQ9UJJ9 305 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 DHRS7Q9Y394 339 aa14.55□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 NEMP2A6NFY4 417 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 TRPC5OSA6NMA1 111 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 SLC22A2O15244 555 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 GRID2O43424 1007 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 MGRN1O60291 552 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 DIAPH2O60879 1101 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 UGT2B4P06133 528 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 KCNA5P22460 613 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 ACRV1P26436 265 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 PRDX6P30041 224 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 IL2P60568 153 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 HERVK_113P63132 956 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 SATB1Q01826 763 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 PDGFRLQ15198 375 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 OR4D1Q15615 310 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 CRY1Q16526 586 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 GEN1Q17RS7 908 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 ZNF678Q5SXM1 525 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 FAM151BQ6UXP7 276 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 TMC5Q6UXY8 1006 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 Q6ZVU0 165 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 ACAD11Q709F0 780 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 CD200R1Q8TD46 325 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 DTX3LQ8TDB6 740 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 ULK4Q96C45 1275 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 RSPRY1Q96DX4 576 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 ASIC4Q96FT7 647 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 LRRC3BQ96PB8 259 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 BTBD10Q9BSF8 475 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 ERVK-6Q9BXR3 956 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 CLPBQ9H078 707 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 GSTO2Q9H4Y5 243 aa14.54□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 ASB8Q9H765 288 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms