RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546048.5

MDM2-234, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5

Gene MDM2, Length 363 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-234	ENST00000546048	POLD2	P49005	469 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ACADVL	P49748	655 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	VAV2	P52735	878 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	AP1S1	P61966	158 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ITK	Q08881	620 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	AP1B1	Q10567	949 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	SGCG	Q13326	291 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	GALNT3	Q14435	633 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF235	Q14590	738 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	LRRC14	Q15048	493 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ALG11	Q2TAA5	492 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	DENND2C	Q68D51	928 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	DHRS13	Q6UX07	377 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	TRIM74	Q86UV6	250 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	NRROS	Q86YC3	692 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	RFX6	Q8HWS3	928 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CCNY	Q8ND76	341 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ASB12	Q8WXK4	309 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	FATE1	Q969F0	183 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	RAB7B	Q96AH8	199 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	HDAC11	Q96DB2	347 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	PDXP	Q96GD0	296 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	AGAP3	Q96P47	875 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6	4e-10	■□□□□ 9.2
MDM2-234	ENST00000546048	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	APOO	Q9BUR5	198 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	LRRC61	Q9BV99	259 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	SLC32A1	Q9H598	525 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	FGF22	Q9HCT0	170 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	UBP1	Q9NZI7	540 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CD84	Q9UIB8	345 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	USP24	Q9UPU5	2620 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048		A0A0J9YYE9	177 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048		A6NNZ2	444 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF487	B1APH4	448 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	FPGT	O14772	594 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	YY2	O15391	372 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	FLRT2	O43155	660 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	GPR39	O43194	453 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	TNFSF14	O43557	240 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	PSTPIP1	O43586	416 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	SOCS5	O75159	536 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	KRT37	O76014	449 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ECEL1	O95672	775 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CP	P00450	1065 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	TRBC1	P01850	177 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	TSHR	P16473	764 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CTNNA2	P26232	953 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	RBL1	P28749	1068 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	VIPR1	P32241	457 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	SERPINB6	P35237	376 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	TRIM23	P36406	574 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	NUDT1	P36639	197 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	GRK6	P43250	576 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	RABIF	P47224	123 aa		5.05	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms