RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533059.5

CHID1-222, Transcript of chitinase domain containing 1, human

TSL 3

Gene CHID1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHID1-222	ENST00000533059	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	ARL10	Q8N8L6	244 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	GLYATL1	Q969I3	302 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	EID2B	Q96D98	161 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	COX14	Q96I36	57 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	TTC25	Q96NG3	672 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	WDR24	Q96S15	920 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	VPS18	Q9P253	973 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	SNX12	Q9UMY4	172 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	SPTBN2	O15020	2390 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	CACNA1E	Q15878	2313 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	CPED1	A4D0V7	1026 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	APRT	P07741	180 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	CKMT1A	P12532	417 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	MYF5	P13349	255 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	ETS1	P14921	441 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	ACTR1B	P42025	376 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	KCNJ1	P48048	391 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	ACTR1A	P61163	376 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	KCTD16	Q68DU8	428 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	IFI44	Q8TCB0	444 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	NAT6	Q93015	286 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	MS4A14	Q96JA4	679 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	ABCG4	Q9H172	646 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	RMI1	Q9H9A7	625 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	IL17C	Q9P0M4	197 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	APPL1	Q9UKG1	709 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	CACNA1A	O00555	2505 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	CES2	O00748	559 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	PRAMEF1	O95521	474 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	GIMD1	P0DJR0	217 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	SPINK2	P20155	84 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	AKT1	P31749	480 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	ADCY8	P40145	1251 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	HADHA	P40939	763 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	TMPRSS15	P98073	1019 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	CDH17	Q12864	832 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	LRP8	Q14114	963 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	POU6F1	Q14863	301 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	KCTD11	Q693B1	232 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	KY	Q8NBH2	561 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	MAPK15	Q8TD08	544 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	VPS35	Q96QK1	796 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	BOC	Q9BWV1	1114 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	OR2AG1	Q9H205	316 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHID1-222	ENST00000533059	CTAGE9	A4FU28	777 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CHID1-222	ENST00000533059	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CHID1-222	ENST00000533059	VEGFD	O43915	354 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CHID1-222	ENST00000533059	MTX2	O75431	263 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CHID1-222	ENST00000533059	GPR89B	P0CG08	455 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CHID1-222	ENST00000533059	ACP5	P13686	325 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CHID1-222	ENST00000533059	TPH1	P17752	444 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CHID1-222	ENST00000533059	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CHID1-222	ENST00000533059	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CHID1-222	ENST00000533059	VPS41	P49754	854 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CHID1-222	ENST00000533059	TERF1	P54274	439 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CHID1-222	ENST00000533059	E2F1	Q01094	437 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CHID1-222	ENST00000533059	CTBS	Q01459	385 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CHID1-222	ENST00000533059	SEMA5A	Q13591	1074 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CHID1-222	ENST00000533059	LAMB3	Q13751	1172 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CHID1-222	ENST00000533059	CHRNA6	Q15825	494 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CHID1-222	ENST00000533059	INSC	Q1MX18	579 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CHID1-222	ENST00000533059	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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