RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514421.1

CCL28-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 28, humanhuman

TSL 3

Gene CCL28, Length 577 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28-204ENST00000514421 SLC18A1P54219 525 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 GEMP55040 296 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 ARL4CP56559 192 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 WNT3AP56704 352 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 PFN3P60673 137 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 PPP2R2AP63151 447 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 SEMA5AQ13591 1074 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 INPP5AQ14642 412 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 PTPRRQ15256 657 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 TPSAB1Q15661 275 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 PCSK7Q16549 785 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 CDKN3Q16667 212 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 ANKRD22Q5VYY1 191 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 LRRC66Q68CR7 880 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 PNCKQ6P2M8 343 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 KDELC1Q6UW63 502 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 Q6ZVL8 140 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 TSPAN33Q86UF1 283 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 CCDC25Q86WR0 208 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 NRSN1Q8IZ57 195 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 LRRC39Q96DD0 335 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 PWWP2AQ96N64 755 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 SPATA13Q96N96 652 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 SMIM14Q96QK8 99 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 TRIB3Q96RU7 358 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 DHRS4Q9BTZ2 278 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 APOOQ9BUR5 198 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 SLC32A1Q9H598 525 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 CCDC134Q9H6E4 229 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 MAGEE1Q9HCI5 957 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 UBP1Q9NZI7 540 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 RSPH14Q9UHP6 348 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 TEX264Q9Y6I9 313 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 CEP192Q8TEP8 1941 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 CAPN8A6NHC0 703 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 PSMD3O43242 534 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 SH3BP5O60239 455 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 SPAG6O75602 509 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 ACSL3O95573 720 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 GSTA2P09210 222 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 MLNP12872 115 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 CEACAM1P13688 526 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 LHCGRP22888 699 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 HTR1BP28222 390 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 TEAD1P28347 426 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 GCAP28676 217 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 ATP5DP30049 168 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 LSP1P33241 339 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 IGFALSP35858 605 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 ETV3P41162 512 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 LMAN1P49257 510 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 STC1P52823 247 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 GPX6P59796 221 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 DPTQ07507 201 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 BNIP3Q12983 259 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 MTM1Q13496 603 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 FZD2Q14332 565 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 IRF4Q15306 451 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 SHBQ15464 509 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 MSS51Q4VC12 460 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 CCDC38Q502W7 563 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 FNBP1LQ5T0N5 605 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 CYS1Q717R9 158 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 ZNF765Q7L2R6 523 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 PIP4P1Q86T03 277 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 CNPY4Q8N129 248 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 PDIK1LQ8N165 341 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 CCDC110Q8TBZ0 833 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 RHBDD1Q8TEB9 315 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 SAP25Q8TEE9 199 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 NUS1Q96E22 293 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 DTD2Q96FN9 168 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 CCDC77Q9BR77 488 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 ABCG8Q9H221 673 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 GBA3Q9H227 469 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 TRABDQ9H4I3 376 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 SAYSD1Q9NPB0 183 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 GPR27Q9NS67 375 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 SLC24A2Q9UI40 661 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL28-204ENST00000514421 SHROOM3Q8TF72 1996 aa8.28□□□□□ -1.08
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