RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513974.5

RAI14-222, Transcript of retinoic acid induced 14, human

TSL 4

Gene RAI14, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAI14-222	ENST00000513974	DNAJC6	O75061	913 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	DNAJB5	O75953	348 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	KIAA0754	O94854	1291 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	PGLS	O95336	258 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	F3	P13726	295 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	ERCC2	P18074	760 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	MAPK9	P45984	424 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	NADK2	Q4G0N4	442 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	OR6C1	Q96RD1	312 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	GPR87	Q9BY21	358 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	VPS16	Q9H269	839 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	RMI1	Q9H9A7	625 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	NOD2	Q9HC29	1040 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	LRBA	P50851	2863 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	LRCH4	O75427	683 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	CLDN1	O95832	211 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	ZNF30	P17039	623 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	COL8A1	P27658	744 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	TNFRSF8	P28908	595 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	CASP14	P31944	242 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	SOX5	P35711	763 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	HCAR3	P49019	387 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	PTS	Q03393	145 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	TRAF2	Q12933	501 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	ZNF235	Q14590	738 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	UGT8	Q16880	541 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	RFX8	Q6ZV50	586 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	TRIM74	Q86UV6	250 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	HPS6	Q86YV9	775 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	NPW	Q8N729	165 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	SCAMP4	Q969E2	229 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	MCEE	Q96PE7	176 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	MGME1	Q9BQP7	344 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	LHX9	Q9NQ69	397 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAI14-222	ENST00000513974	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	SPAG6	O75602	509 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	ASMTL	O95671	621 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	PEX11B	O96011	259 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	LDLR	P01130	860 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	CLCNKA	P51800	687 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	GFER	P55789	205 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	RIPPLY3	P57055	190 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	JAM2	P57087	298 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	SH3BP2	P78314	561 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	LRRC66	Q68CR7	880 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	MON1B	Q7L1V2	547 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	BBS5	Q8N3I7	341 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	PRR7	Q8TB68	274 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	CT55	Q8WUE5	264 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	GAN	Q9H2C0	597 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	ACTL8	Q9H568	366 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	OGFR	Q9NZT2	677 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	CD84	Q9UIB8	345 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	DPM1	O60762	260 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	UBXN7	O94888	489 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RAI14-222	ENST00000513974	TNFAIP3	P21580	790 aa		13.07	□□□□□ -0.32

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