RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511409.1

TRAPPC11-207, Transcript of trafficking protein particle complex 11, humanhuman

TSL 4

Gene TRAPPC11, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11-207ENST00000511409 TRAF3Q13114 568 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 MYBPHQ13203 477 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 CALCRLQ16602 461 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 FAM69BQ5VUD6 431 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 PMS2CLQ68D20 193 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 RHBDF2Q6PJF5 856 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 C16orf54Q6UWD8 224 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 TMCO3Q6UWJ1 677 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 GPR180Q86V85 440 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 HACE1Q8IYU2 909 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 SCYL3Q8IZE3 742 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 BEST3Q8N1M1 668 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 IQCF1Q8N6M8 205 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 GSDMBQ8TAX9 411 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 EVPLQ92817 2033 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 CCDC34Q96HJ3 373 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 EGLN2Q96KS0 407 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 SMC6Q96SB8 1091 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 TMEM204Q9BSN7 226 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 TEX12Q9BXU0 123 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 SIL1Q9H173 461 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 EPB41L5Q9HCM4 733 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 PDE7BQ9NP56 450 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 LTB4R2Q9NPC1 389 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 MTMR10Q9NXD2 777 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 KLHL20Q9Y2M5 609 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 NFS1Q9Y697 457 aa3.4□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 CPED1A4D0V7 1026 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 CDRT15L2A8MXV6 281 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 LACTBL1A8MY62 500 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 PROB1E7EW31 1015 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 MITFO75030 526 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 TMCC2O75069 709 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 GAGE7O76087 117 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 CLDN14O95500 239 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 TUBBP07437 444 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 GAGE12FP0CL80 117 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 GAGE12GP0CL81 117 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 GAGE12IP0CL82 117 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 SRCP12931 536 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 ACADLP28330 430 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 LMAN1P49257 510 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 GPR143P51810 404 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 TAS2R38P59533 333 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 PDE1BQ01064 536 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 EGR4Q05215 589 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 GAGE1Q13065 139 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 GAGE4Q13068 117 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 NTRK2Q16620 822 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 IGSF11Q5DX21 431 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 FRG2Q64ET8 278 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 ZNF280DQ6N043 979 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 PDXDC1Q6P996 788 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 DLK2Q6UY11 383 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 EPHX4Q8IUS5 362 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 CLIP4Q8N3C7 705 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 APPL2Q8NEU8 664 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 OR2AK2Q8NG84 335 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 ELP5Q8TE02 316 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 SCMH1Q96GD3 660 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 ZNF479Q96JC4 524 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 FIZ1Q96SL8 496 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 PAFAH2Q99487 392 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 SEMA3CQ99985 751 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 ZPBPQ9BS86 351 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 DNAJC18Q9H819 358 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 ANKEF1Q9NU02 776 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 PAG1Q9NWQ8 432 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 WNT16Q9UBV4 365 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 MALT1Q9UDY8 824 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 FBXL2Q9UKC9 423 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 ACSL5Q9ULC5 683 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 TTLL3Q9Y4R7 772 aa3.39□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 MAP2K7O14733 419 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 ENTPD3O75355 529 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 KDM4BO94953 1096 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 NGFRP08138 427 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 FCGR1AP12314 374 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 SELLP14151 372 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 MMP9P14780 707 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 TMPOP42166 694 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 STAT2P52630 851 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 TMF1P82094 1093 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC11-207ENST00000511409 PPP2R2BQ00005 443 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms