RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508936.1

SMAD1-AS2-201, SMAD1 antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD1-AS2, Length 1,090 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GPR63Q9BZJ6 419 aa3.1□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa3.1□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FGF22Q9HCT0 170 aa3.1□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa3.1□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 AMDHD2Q9Y303 409 aa3.1□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 UTYO14607 1347 aa3.1□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 A0A0G2JLW4 131 aa3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TTC36A6NLP5 189 aa3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PEX14O75381 377 aa3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 COX7A2P14406 83 aa3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ITGA2P17301 1181 aa3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 S1PR1P21453 382 aa3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 UFM1P61960 85 aa3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GAGE5Q13069 117 aa3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GAGE6Q13070 117 aa3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TAF12Q16514 161 aa3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GGNBP1Q5YKI7 109 aa3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RGMBQ6NW40 437 aa3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC22A25Q6T423 547 aa3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C1orf87Q8N0U7 546 aa3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZBTB2Q8N680 514 aa3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ANKRD42Q8N9B4 389 aa3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HUS1BQ8NHY5 278 aa3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KLHL29Q96CT2 875 aa3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAM110AQ9BQ89 295 aa3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 POLR3GLQ9BT43 218 aa3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KCNN2Q9H2S1 579 aa3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MPP6Q9NZW5 540 aa3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RASAL2Q9UJF2 1139 aa3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ERVK-11Q9UQG0 969 aa3.09□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SEC14L5O43304 696 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CYC1P08574 325 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ERVK-10P10266 1014 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 G6PDP11413 515 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ACADSP16219 412 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FASLGP48023 281 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CCT5P48643 541 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MMP14P50281 582 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C2orf68Q2NKX9 166 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC45A4Q5BKX6 768 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SIRPB2Q5JXA9 342 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CYP26C1Q6V0L0 522 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPATA6LQ8N4H0 392 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LINC00612Q8N6U2 182 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BMPERQ8N8U9 685 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC41A2Q96JW4 573 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 IWS1Q96ST2 819 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HEMGNQ9BXL5 484 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PPCSQ9HAB8 311 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MMP25Q9NPA2 562 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GPR108Q9NPR9 543 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C2orf42Q9NWW7 574 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BARHL2Q9NY43 387 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PADI1Q9ULC6 663 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TBX20Q9UMR3 447 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 A4GNTQ9UNA3 340 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CSAG2Q9Y5P2 127 aa3.08□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa3.07□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TSPAN4O14817 238 aa3.07□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.07□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CDC25CP30307 473 aa3.07□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BDKRB2P30411 391 aa3.07□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HOXC8P31273 242 aa3.07□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DDIT3P35638 169 aa3.07□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RPP30P78346 268 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TDGQ13569 410 aa3.07□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GPR68Q15743 365 aa3.07□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BAK1Q16611 211 aa3.07□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 STXBP5Q5T5C0 1151 aa3.07□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HAPLN4Q86UW8 402 aa3.07□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TDRPQ86YL5 185 aa3.07□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZBTB10Q96DT7 871 aa3.07□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SCRN2Q96FV2 425 aa3.07□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 UBXN10Q96LJ8 280 aa3.07□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms