RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LCE1FQ5T754 118 aa4.4□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa4.4□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C18orf63Q68DL7 685 aa4.4□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa4.4□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR13A1Q8NGR1 328 aa4.4□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ETNPPLQ8TBG4 499 aa4.4□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PIGTQ969N2 578 aa4.4□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HES6Q96HZ4 224 aa4.4□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HARBI1Q96MB7 349 aa4.4□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WDFY2Q96P53 400 aa4.4□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SYT17Q9BSW7 474 aa4.4□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa4.4□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTPRCP08575 1304 aa4.4□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C1orf226A1L170 272 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CTAGE9A4FU28 777 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 B4E171 279 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 J3KRW8 73 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 M0QZ24 198 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 P2RY10O00398 339 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 JRKO75564 520 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CTAGE8P0CG41 777 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CD53P19397 219 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UGT1A1P22309 533 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IL15P40933 162 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBA7P41226 1012 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TSPAN7P41732 249 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLDN20P56880 219 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF234Q14588 700 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACCSLQ4AC99 568 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STXBP5Q5T5C0 1151 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LCN10Q6JVE6 187 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATG9AQ7Z3C6 839 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CTAGE4Q8IX94 777 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IL17RCQ8NAC3 791 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMARCE1Q969G3 411 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARHGEF26Q96DR7 871 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C7orf26Q96N11 449 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 QRFPRQ96P65 431 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PGLYRP2Q96PD5 576 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDZD7Q9H5P4 517 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABCF3Q9NUQ8 709 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNE2Q9Y6J6 123 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAU2Q9Y6X3 613 aa4.39□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa4.38□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa4.38□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM90A26D6RGX4 464 aa4.38□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LINC01565O15544 149 aa4.38□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TBX18O95935 607 aa4.38□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CETPP11597 493 aa4.38□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRT9P35527 623 aa4.38□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC96Q2M329 555 aa4.38□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMTC3Q6ZXV5 915 aa4.38□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 THAP6Q8TBB0 222 aa4.38□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WBP1Q96G27 269 aa4.38□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UNC45AQ9H3U1 944 aa4.38□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FBXL2Q9UKC9 423 aa4.38□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KLHL20Q9Y2M5 609 aa4.38□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLIC4Q9Y696 253 aa4.38□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PIAS3Q9Y6X2 628 aa4.38□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa4.37□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A1W2PP11 408 aa4.37□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM172BPA6NC97 362 aa4.37□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRR23AA6NEV1 266 aa4.37□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNN4O15554 427 aa4.37□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WDR1O75083 606 aa4.37□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CD4P01730 458 aa4.37□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FMO5P49326 533 aa4.37□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa4.37□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TTI2Q6NXR4 508 aa4.37□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C19orf48Q6RUI8 117 aa4.37□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SEPT14Q6ZU15 432 aa4.37□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CPLX4Q7Z7G2 160 aa4.37□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NFE4Q86UQ8 179 aa4.37□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC38A5Q8WUX1 472 aa4.37□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UHRF2Q96PU4 802 aa4.37□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EPYCQ99645 322 aa4.37□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRC1Q9BTT6 524 aa4.37□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COPG2Q9UBF2 871 aa4.37□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR14J1Q9UGF5 321 aa4.37□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CAPN9O14815 690 aa4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATP2A1O14983 1001 aa4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANKRD28O15084 1053 aa4.36□□□□□ -1.71
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNHIT1O43257 154 aa4.36□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms