RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494422.1

BRD9-211, Transcript of bromodomain containing 9, humanhuman

TSL 3

Gene BRD9, Length 449 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD9-211ENST00000494422 BPIP17213 487 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 GM2AP17900 193 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 PGAM1P18669 254 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 SDHBP21912 280 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 ITPKAP23677 461 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 IGFALSP35858 605 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 ETV3P41162 512 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 PTGER3P43115 390 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 CHRNA4P43681 627 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 RPL21P46778 160 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 RXRGP48443 463 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 PRAMEP78395 509 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 CDK3Q00526 305 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 NHLH1Q02575 133 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 CACNG1Q06432 222 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 SLC14A1Q13336 389 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 FGL2Q14314 439 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 SPARCL1Q14515 664 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 ITIH4Q14624 930 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 INPP5AQ14642 412 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 POU6F1Q14863 301 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 NFATC4Q14934 902 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 IRF4Q15306 451 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 CSRP2Q16527 193 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 WSCD2Q2TBF2 565 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 INAVAQ3KP66 663 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 LRRC73Q5JTD7 316 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 SPANXN3Q5MJ09 141 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 RAET1GQ6H3X3 334 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 MRNIPQ6NTE8 343 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 AFTPHQ6ULP2 937 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 GCNT7Q6ZNI0 430 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 ZNF534Q76KX8 674 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 SNX20Q7Z614 316 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 TMEM135Q86UB9 458 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 PARGQ86W56 976 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 RELL1Q8IUW5 271 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 FRMD1Q8N878 549 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 OR4K2Q8NGD2 314 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 ZNF398Q8TD17 642 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 GLYATL1Q969I3 302 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 COX14Q96I36 57 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 HIC2Q96JB3 615 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 BMFQ96LC9 184 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 WDR92Q96MX6 357 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 TCF12Q99081 682 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 APOL2Q9BQE5 337 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 TRIM51Q9BSJ1 452 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 LRRC1Q9BTT6 524 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 APOOQ9BUR5 198 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 SPATA16Q9BXB7 569 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 GGT7Q9UJ14 662 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 GPR34Q9UPC5 381 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 SNX24Q9Y343 169 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 SPO11Q9Y5K1 396 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 ARL5AQ9Y689 179 aa6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 SPAG17Q6Q759 2223 aa6.34□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa6.34□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 NEMP2A6NFY4 417 aa6.34□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 A8MX80 341 aa6.34□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 AURKAO14965 403 aa6.34□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 RASGRP1O95267 797 aa6.34□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 PRAMEF1O95521 474 aa6.34□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 PRKCGP05129 697 aa6.34□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 IVLP07476 585 aa6.34□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 OGNP20774 298 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 MGAT1P26572 445 aa6.34□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 TNFRSF8P28908 595 aa6.34□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 MC4RP32245 332 aa6.34□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 CTSKP43235 329 aa6.34□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 TTPAP49638 278 aa6.34□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 PLTPP55058 493 aa6.34□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 ADARP55265 1226 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 NXPH1P58417 271 aa6.34□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 GUCY2DQ02846 1103 aa6.34□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 NFATC2Q13469 925 aa6.34□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 GTF2H3Q13889 308 aa6.34□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 LRP8Q14114 963 aa6.34□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 SEPT6Q14141 434 aa6.34□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 SLMAPQ14BN4 828 aa6.34□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.34□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 CCDC38Q502W7 563 aa6.34□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
BRD9-211ENST00000494422 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms