RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 HHIPL1Q96JK4 782 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 MTRRQ9UBK8 725 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 VPS28Q9UK41 221 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 BTRCQ9Y297 605 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 CROCCQ5TZA2 2017 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 SUPT3HB4E1H0 165 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 PIP5K1BO14986 540 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 DNAJA2O60884 412 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 SUPT3HO75486 399 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 CLDN11O75508 207 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 PRAMEF12O95522 483 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 OGNP20774 298 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 AGTR2P50052 363 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 ARF5P84085 180 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 USP41Q3LFD5 358 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 KIAA1841Q6NSI8 718 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 METTL25Q8N6Q8 603 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 LRCH3Q96II8 777 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 LRGUKQ96M69 825 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 SLC22A12Q96S37 553 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 TMEM175Q9BSA9 504 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 TUBB1Q9H4B7 451 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 ILVBLA1L0T0 632 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 NIPSNAP2O75323 286 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 ASLP04424 464 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 TUFMP49411 452 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 XIAPP98170 497 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 NFKB2Q00653 900 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 TRAF2Q12933 501 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 TLR1Q15399 786 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 CLYBLQ8N0X4 340 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 DCUN1D1Q96GG9 259 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 PKP2Q99959 881 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 TRMOQ9BU70 441 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 LINC00032P0C843 101 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 CHN2P52757 468 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 ADGRF1Q5T601 910 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 FAM117BQ6P1L5 589 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 DDIASQ8IXT1 998 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 AUTS2Q8WXX7 1259 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 PEX13Q92968 403 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 CNBD2Q96M20 576 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 IL1RL2Q9HB29 575 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 RNF112Q9ULX5 631 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 TIMM22Q9Y584 194 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 PRORSD1PA6NEY8 169 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 IQCF5A8MTL0 148 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 MRASO14807 208 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 AZIN1O14977 448 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 ECI2O75521 394 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 TMCC1O94876 653 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 MC4RP32245 332 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 STX5Q13190 355 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 TAF12Q16514 161 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 DEFB115Q30KQ5 88 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 SCIMPQ6UWF3 145 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 ARPINQ7Z6K5 226 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 RETREG3Q86VR2 466 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 CARNMT1Q8N4J0 409 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 TWIST2Q8WVJ9 160 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 BIRC8Q96P09 236 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 UNC93B1Q9H1C4 597 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 TAS2R13Q9NYV9 303 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 C2orf81A6NN90 581 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 TRIM38O00635 465 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 VILLO15195 856 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 C1RP00736 705 aa12.78□□□□□ -0.36
PRAME-213ENST00000492657 GPX3P22352 226 aa12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms