RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 RIMKLBQ9ULI2 386 aa9.58□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 PADI4Q9UM07 663 aa9.58□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 MYO7AQ13402 2215 aa9.58□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 DYTNA2CJ06 578 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 KLHL33A6NCF5 533 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 E9PBE3 544 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 H3BNX3 289 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 TXNDC9O14530 226 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 INSIG1O15503 277 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 FZD6O60353 706 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 KLHL41O60662 606 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 TMCC1O94876 653 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 CYBBP04839 570 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 SERPINF2P08697 491 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 CISD3P0C7P0 127 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 HLA-DPA1P20036 260 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 ARNTP27540 789 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 NMBRP28336 390 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 HLA-FP30511 346 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 RPL5P46777 297 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 CSRP3P50461 194 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 ITKQ08881 620 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 ART3Q13508 389 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 CDH18Q13634 790 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 DMC1Q14565 340 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF235Q14590 738 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 SFT2D3Q587I9 215 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 TCEAL5Q5H9L2 206 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 PPM1JQ5JR12 505 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 FAM78AQ5JUQ0 283 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 SIRPB2Q5JXA9 342 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 CES3Q6UWW8 571 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 CMC1Q7Z7K0 106 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 SNX32Q86XE0 403 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF354CQ86Y25 554 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 HPS6Q86YV9 775 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 CNTN4Q8IWV2 1026 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 DSELQ8IZU8 1212 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 PHTF2Q8N3S3 785 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 STYXQ8WUJ0 223 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 NAT14Q8WUY8 206 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 ING5Q8WYH8 240 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 FGF13Q92913 245 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 SMARCD2Q92925 531 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 MFSD3Q96ES6 412 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 DCUN1D1Q96GG9 259 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF385DQ9H6B1 395 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF696Q9H7X3 374 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 PIDD1Q9HB75 910 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 CLEC1BQ9P126 229 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 SLC17A6Q9P2U8 582 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 HS3ST2Q9Y278 367 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 TCAF1Q9Y4C2 921 aa9.57□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 ARHGAP10A1A4S6 786 aa9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 ANKRD33BA6NCL7 494 aa9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 K7ERQ8 282 aa9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 LINC01565O15544 149 aa9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 LDB2O43679 373 aa9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 ZBTB14O43829 449 aa9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 STAMBPO95630 424 aa9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 NDST3O95803 873 aa9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 ME2P23368 584 aa9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 FSHRP23945 695 aa9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 FCARP24071 287 aa9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 DNAJB13P59910 316 aa9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 FOLH1Q04609 750 aa9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 ACVR1Q04771 509 aa9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 USP10Q14694 798 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 GAB4Q2WGN9 574 aa9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 EML3Q32P44 896 aa9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 PIGGQ5H8A4 983 aa9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 PITRM1Q5JRX3 1037 aa9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 DGKKQ5KSL6 1271 aa9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 LY6G5CQ5SRR4 150 aa9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 RETSATQ6NUM9 610 aa9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 UGT2A3Q6UWM9 527 aa9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 LINGO4Q6UY18 593 aa9.56□□□□□ -0.88
POLR1A-208ENST00000486964 KIAA0408Q6ZU52 694 aa9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms