RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 TTLL3Q9Y4R7 772 aa12.57□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 A0A0J9YYE9 177 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 B8ZZF3 427 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 PSMD11O00231 422 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 EML2O95834 649 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 PRLP01236 227 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 TRBC1P01850 177 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 IVLP07476 585 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 CSF2RBP32927 897 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 GARSP41250 739 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 ACTR1BP42025 376 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 NOP2P46087 812 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 TAS2R40P59535 323 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 ACTR1AP61163 376 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 DPTQ07507 201 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 NIPAL4Q0D2K0 466 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 GALNT2Q10471 571 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 NR1D2Q14995 579 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 FAM71BQ8TC56 605 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 AP2M1Q96CW1 435 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 SGF29Q96ES7 293 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 PRKAB1Q9Y478 270 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa12.56□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 GRID2IPA4D2P6 1211 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 MYO1FO00160 1098 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 MATN3O15232 486 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 CLDN7O95471 211 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 HLA-DQB2P05538 268 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 TEAD1P28347 426 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 STC1P52823 247 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 EPHB1P54762 984 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 NFKB2Q00653 900 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 BIRC2Q13490 618 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 PYCR3Q53H96 274 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 RALGPS1Q5JS13 557 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 MANEAQ5SRI9 462 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 DTX1Q86Y01 620 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 LRRC57Q8N9N7 239 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 ARRDC2Q8TBH0 407 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 MAML1Q92585 1016 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 TMEM159Q96B96 161 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 OR2M4Q96R27 311 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 WDR24Q96S15 920 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 GOLPH3Q9H4A6 298 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 KCTD5Q9NXV2 234 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 CAPN8A6NHC0 703 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 KIF5CO60282 957 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 ASMTLO95671 621 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 FAM87AP0C7U9 286 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 NFKBIAP25963 317 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 LIMK2P53671 638 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 GBE1Q04446 702 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 NFATC3Q12968 1075 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 HADHQ16836 314 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 ALG1LQ6GMV1 187 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 C11orf63Q6NUN7 778 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 SLC35F6Q8N357 371 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 PQLC3Q8N755 202 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 KCTD6Q8NC69 237 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 LPCAT1Q8NF37 534 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 SLC37A2Q8TED4 501 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 HTR3CQ8WXA8 447 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 COX14Q96I36 57 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 CDH19Q9H159 772 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 OCIAD1Q9NX40 245 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 SEPT10Q9P0V9 454 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa12.54□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 MYO18BQ8IUG5 2567 aa12.53□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 FADS2P1A8MWK0 482 aa12.53□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 FANCGO15287 622 aa12.53□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 SLC28A2O43868 658 aa12.53□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 PROSCO94903 275 aa12.53□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 MMP2P08253 660 aa12.53□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 ZNF30P17039 623 aa12.53□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 GPR3P46089 330 aa12.53□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 GNG11P61952 73 aa12.53□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 MESDQ14696 234 aa12.53□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 ZNF569Q5MCW4 686 aa12.53□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 ZNF765Q7L2R6 523 aa12.53□□□□□ -0.4
PRAME-212ENST00000485532 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa12.53□□□□□ -0.4
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