RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483765.5

RPL21-208, Transcript of ribosomal protein L21, human

TSL 3

Gene RPL21, Length 453 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL21-208	ENST00000483765	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	CDA	P32320	146 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	PEX5	P50542	639 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	MYBPH	Q13203	477 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	GSTA3	Q16772	222 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	AMZ1	Q400G9	498 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	MMEL1	Q495T6	779 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	TDRP	Q86YL5	185 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	PGBD5	Q8N414	524 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	ZBTB2	Q8N680	514 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	ZNF570	Q96NI8	536 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	HAUS8	Q9BT25	410 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	NFS1	Q9Y697	457 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	USP54	Q70EL1	1684 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	PIEZO1	Q92508	2521 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765		A0A1B0GUV1	79 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	IFNL4	K9M1U5	179 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	SLC16A5	O15375	505 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	NDUFS7	O75251	213 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	DPEP1	P16444	411 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	MAOA	P21397	527 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	GAS1	P54826	345 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	CALCRL	Q16602	461 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	KIF19	Q2TAC6	998 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	4.68	□□□□□ -1.66	1e-9	■■□□□ 13.6
RPL21-208	ENST00000483765	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	RFFL	Q8WZ73	363 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	ITSN1	Q15811	1721 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	CACNA1A	O00555	2505 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	MEGF6	O75095	1541 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	SMTNL1	A8MU46	457 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	SEC14L2	O76054	403 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	TMEM63A	O94886	807 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	MMP10	P09238	476 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	SSTR2	P30874	369 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	STX2	P32856	288 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	GNAQ	P50148	359 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	CASP6	P55212	293 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	DDR1	Q08345	913 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	DLG1	Q12959	904 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	SNTA1	Q13424	505 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	ALG11	Q2TAA5	492 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	WDR63	Q8IWG1	891 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	LMO3	Q8TAP4	145 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	MTBP	Q96DY7	904 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	SCMH1	Q96GD3	660 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	ADGRG7	Q96K78	797 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	DUX5	Q96PT3	197 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	OR1F2P	Q96R84	312 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	SH3GL2	Q99962	352 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	SPRY4	Q9C004	299 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	ASAH2	Q9NR71	780 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	MUC3A	Q02505	3323 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	ADGRB1	O14514	1584 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RPL21-208	ENST00000483765	LAMA3	Q16787	3333 aa		4.66	□□□□□ -1.66

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